研究課題/領域番号 |
23KJ1813
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研究機関 | 静岡県立大学 |
研究代表者 |
岡本 拓実 静岡県立大学, 薬食生命科学総合学府, 特別研究員(PD)
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研究期間 (年度) |
2023-04-25 – 2026-03-31
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キーワード | ジャガイモシストセンチュウ / ソラノエクレピンA / 異宿主発現 / バイオインフォマティクス |
研究実績の概要 |
世界中で甚大な被害をもたらしているジャガイモシストセンチュウ(potato cys tnematode: PCN)の孵化誘因物質として知られているsolanoeclepin A(solA)の生合成遺伝子・経路の同定を目指した。採択前には、ナス科植物のモデル植物であるマイクロトムを用いたゲノムのリシーケンシングや孵化活性に準じたトランスクリプトーム解析を行うことによって、いくつかの遺伝子を生合成候補遺伝子として挙げていた。これをもとに、本年度はNicotiana benthamianaをもちいたアグロインフィルトレーション法による遺伝子の一過性発現を行った。特に、酸化酵素であるP450に焦点を当て、実験を行ったところ、野生株では確認できない化合物ピークをいくつか発見することができた。そこで、現在は、この新たな化合物の解析に取り組んでいる。また、同じ植物寄生性センチュウであるダイズシストセンチュウ(soybean cyst nematode: SCN)に関しても、マメ科植物のモデル植物であるミヤコグサを用いて実験を行っている。まずは、ミヤコグサでのSCNの孵化活性が確認できていなかったので、PCNの場合と同様に水耕栽培での検証、また、ミヤコグサの突然変異系統であるスーパールートを用いた培養組織での孵化活性試験を行った。その結果、水耕栽培液では孵化を確認できなかったが、スーパールートの培養組織そのものの抽出液で孵化を確認できた。これより、今後はスーパールートを実験材料として研究を行っていく。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
研究計画の1年目に計画していた、遺伝子の異宿主発現を候補遺伝子に対して行えており、また、その結果生じた新たな化合物に対して解析を行えている。さらに、2年目に計画しているノックアウト体の作出にも取り掛かっているため、おおむね順調に進んでいると判断した。
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今後の研究の推進方策 |
現在行っている種々の異宿主発現を引き続き行うことによって、多くの生合成遺伝子を同定していく。また、それらの遺伝子を対象とした植物ノックアウト体、ノックダウン体の作製を行うことによって、遺伝子の機能解析を詳細に進めていく。加えて、新たに始めたダイズシストセンチュウに関する研究を絡めながら、solAの生合成の全容解明を行う。
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次年度使用額が生じた理由 |
実験上、繰り返し培養のできるものが多く、そのため出費を抑えることができた。次年度からは新たにダイズシストセンチュウに関する研究を行い、それに関する詳細なNGS解析を行う予定になっている。
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