研究課題/領域番号 |
24248028
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研究種目 |
基盤研究(A)
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
森林科学
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研究機関 | 京都大学 |
研究代表者 |
井鷺 裕司 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (50325130)
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研究分担者 |
津村 義彦 筑波大学, 大学院生命環境科学研究科, 教授 (20353774)
上野 真義 独立行政法人森林総合研究所, 研究員 (40414479)
瀬戸口 浩彰 京都大学, 大学院人間・環境学研究科, 教授 (70206647)
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連携研究者 |
阪口 翔太 東京大学, 大学院総合文化研究科, 研究員 (50726809)
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研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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キーワード | 適応進化 / 次世代シーケンサー / オーストラリア / 連鎖地図 / RAD-seq |
研究成果の概要 |
多様な環境に適応進化した樹木を対象に,複数集団のサンプルを数万遺伝子座オーダーで比較解読し、適応進化プロセスを解析した。共通圃場実験による形質の評価と遺伝子型の分析により環境適応に関わる形質多型には遺伝的背景があることを明らかにした。ゲノム情報を縮約して解読するRAD-seqや翻訳されたゲノム領域を解読するRNA-seqによって、適応進化に関与した可能性があるゲノム領域を探索し、いくつかの候補遺伝子を見いだした。また、胚乳が種子親の減数分裂に由来する半数体組織であることを利用して、1母樹と80個の胚乳の遺伝子型を次世代シーケンサーで解読することにより高密度連鎖地図を作成することにも成功した。
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自由記述の分野 |
保全遺伝学
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