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2013 年度 実績報告書

ゲノム情報に基づく乳癌内分泌療法反応性関連遺伝子の同定及びタンパク機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 24300338
研究機関独立行政法人国立がん研究センター

研究代表者

前佛 均  独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (90372820)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワードC10orf11 / 乳がん / 内分泌治療 / 個別化医療
研究実績の概要

平成24年度までに行われた240例の乳がんタモキシフェン治療症例のgermline DNAを用いた網羅的遺伝子多型解析の結果、15個の遺伝子多型(SNP)がゲノムワイド有意水準を満たすレベルで、治療効果(治療後の予後)と関連を認めた。さらに追加サンプル222例を用いた検証実験の結果より、上記15 SNPのうち10番染色体上のC10orf11遺伝子については、2つの独立した乳がんサンプルセットにおいても再発のリスクと強く関連することが再現された(全検体を組み合わせた結果:log-rank P= 1.26 × 10(-10)、Hazard ratio = 4.51)。
C10orf11遺伝子は、メラノサイトの分化に関係している可能性が報告されているが、その機能はほとんど知られていない遺伝子である。正常組織における発現状況を検討したところ、副腎、肝において、比較的高い発現を認めたが、正常乳腺組織においては高い発現を認めなかった。また、同遺伝子の細胞増殖能への影響を検討するため、一過性強制発現系で同遺伝子を過剰発現し、MTT assayにて検討を行ったが、明らかな細胞増殖能への影響を認めなかった。さらにC10orf11遺伝子の発現抑制細胞を作成し、細胞増殖能の変化を検討するため、si-RNAオリゴを作成した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ゲノムワイド関連解析の結果、有意水準を満たすSNPが複数同定され、さらに検証試験の結果、1 SNPで再現性が確認された。その結果、1遺伝子(C10orf11遺伝子)に焦点を当てて解析を進めることが可能となった。当初の予定よりeffectの強いSNPが同定され、臨床有用性の高い結果が得られる可能性が強まったため。

今後の研究の推進方策

効果的なsi-RNAのオリゴ配列を決定し、C10orf11発現抑制系を用いて細胞増殖抑制能への影響を検討する。C10orf11タンパクの細胞内局在、タンパク定量化のため特異抗体を作成し、結合タンパクなどについても検討をすすめる。結合タンパクの機能を熟考し、たとえばリン酸化酵素などであれば、関係しうる代表的細胞内シグナルなども考慮しながら、内分泌療法反応性との関連について、そのメカニズムを解明する。

次年度使用額が生じた理由

当初は平成25年12月までに乳がん内分泌療法反応性関連遺伝子について十分な遺伝子発現抑制効果を有するsi-RNA オリゴおよび同遺伝子産物に対する特異的抗体を作成し、平成26年3月末までに細胞増殖抑制効果を確認し、その抗体が内在性のタンパクを認識する予定であった。しかしsi-RNAオリゴについては、上記期間までに効果的に目的遺伝子の発現を抑制しうるものがデザインできず、また特異的抗体については抗体作成に想定外の時間を要したため。

次年度使用額の使用計画

効果的に目的遺伝子の発現を抑制するsi-RNAを設計・作成するのに約27万円を費やし、さらに約140万円をかけて特異的抗体を用いた免疫細胞染色および免疫組織染色を行う計画とした。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] CYP2D6 Genotype and Adjuvant Tamoxifen: Meta-Analysis of Heterogeneous Study Populatins2014

    • 著者名/発表者名
      Province MA, Goetz MP, Zembutsu H, et al
    • 雑誌名

      Clin Pharmacol Ther.

      巻: 95 ページ: 216-227

    • DOI

      10.1038/clpt.2013.186

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A genome-wide association study of chemotherapy-induced alopecia in breast cancer patients.2013

    • 著者名/発表者名
      Chung S,Low SK, Zembutsu H,et al
    • 雑誌名

      Breast Cancer Res.

      巻: 15 ページ: R81

    • DOI

      10.1186/bcr3475

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Important and critical scientific aspects in pharmacogenomics analysis: lessons from controversial results of tamoxifen and CYP2D6 studies.2013

    • 著者名/発表者名
      Kiyotani K, Mushiroda T, Zembutsu H,et al
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 58 ページ: 327-333

    • DOI

      10.1038/jhg.2013.39

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide association study of chemotherapeutic agent-tnduced severe neutropenia/leucopenia for patients in Biobank Japan.2013

    • 著者名/発表者名
      Low SK, Chung S, Zembutsu H, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: 104 ページ: 1074-1082

    • DOI

      10.1111/cas.12186

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 遺伝子解析による薬物反応性 有害事象 ゲノムワイド関連解析によるゲムシタビン副作用関連遺伝子の同定.2013

    • 著者名/発表者名
      前佛 均, 清谷 一馬, 宇野 智子, 木村 康利, 莚田 泰誠, 光畑 直喜, 伊奈 志乃美, 鬼原 史, 山上 裕機, 平田 公一, 中村 祐輔
    • 雑誌名

      Surgery Frontier

      巻: 20 ページ: 198-201

  • [雑誌論文] 遺伝子解析による薬物反応性 抗腫瘍効果 浸潤性膀胱癌に対する術前化学療法 感受性予測システムの構築2013

    • 著者名/発表者名
      加藤 陽一郎, 高田 亮, 岩崎 一洋, 小原 航, 藤岡 知昭, 前佛 均, 中村 祐輔
    • 雑誌名

      Surgery Frontier

      巻: 20 ページ: 194-197

  • [雑誌論文] ゲノムワイド関連解析による疾病関連遺伝子の同定 子宮内膜症2013

    • 著者名/発表者名
      宇野 智子, 前佛 均, 中村 祐輔.
    • 雑誌名

      Surgery Frontier

      巻: 20 ページ: 184-187

  • [雑誌論文] ゲノムワイド関連解析による疾病関連遺伝子の同定 ケロイド2013

    • 著者名/発表者名
      中島 光子, 前佛 均.
    • 雑誌名

      Surgery Frontier

      巻: 20 ページ: 178-183

  • [学会発表] Prospective Clinical Study to Clarify the Relationship between CYP2D6 Genotype and the Therapeutic Effects of Preoperative Tamoxifen Therapy2013

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Zembutsu, Seigo Nakamura, Sadako Akashi, Takashi Kuwayama, Tomoko Takamaru, Yusuke Nakamura et al
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第58回大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2013-11-20 – 2013-11-23
  • [学会発表] A replication study of a GWAS identified three genetic loci associated with clinical outcomes of patients with invasive breast cancer2013

    • 著者名/発表者名
      Goro Kutomi, Koichi Hirata, Kazuma Kiyotani, Taisei Mushiroda, Tatsuhiko Tsunoda, Fuminori Aki, Yuichi Takatsuka, Minoru Okazaki, Shozo Ohsumi, Takashi Yamakawa, Mitsunori Sasa, Yusuke Nakamura and Hitoshi Zembutsu
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2013-10-03 – 2013-10-05
  • [学会発表] A prospective study to examine the availability of the prediction system of Neoadjuvant Chemotherapy for Muscle Invasive Bladder Cancer2013

    • 著者名/発表者名
      Yoichiro Kato, Hitoshi Zembutsu, Ryo Takata, Kazuhiro Iwasaki, Wataru Obara, Yusuke Nakamura, Tomoaki Fujioka
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2013-10-03 – 2013-10-05
  • [学会発表] Genome-wide association studies identify different susceptibility loci for various subtypes of epithelial ovarian cancer in the Japanese population2013

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Zembutsu, Pei-Chieng Cha, Akira Hirasawa, Atsushi Takahashi, Tomoko Akahane, Siew-Kee Low, Michiaki Kubo, Daisuke Aoki, Yusuke Nakamura
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2013-10-03 – 2013-10-05
  • [学会発表] A genome-wide association study (GWAS) of docetaxel-induced peripheral neuropathy in CALGB 90401 (Alliance)2013

    • 著者名/発表者名
      Daniel Louis Hertz, Kouros Owzar, Susan Halabi, William Kevin Kelly, Hitoshi Zembutsu, et al
    • 学会等名
      ASCO Annual Meeting
    • 発表場所
      Chicago, IL, USA
    • 年月日
      2013-05-31 – 2013-06-04
  • [学会発表] ゲノムワイド関連解析によるタモキシフェン反応性診断2013

    • 著者名/発表者名
      前佛 均, 平田 公一, 岡崎 稔, 安藝 史典, 高塚 雄一, 大住 省三, 山川 卓, 笹 三徳, 中村 祐輔
    • 学会等名
      日本外科学会 第113回大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2013-04-11 – 2013-04-13

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公開日: 2016-06-01  

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