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2012 年度 実績報告書

三宅島2000年噴火後の土壌微生物生態系回復過程の解析

研究課題

研究課題/領域番号 24310003
研究種目

基盤研究(B)

研究機関茨城大学

研究代表者

太田 寛行  茨城大学, 農学部, 教授 (80168947)

研究分担者 成澤 才彦  茨城大学, 農学部, 准教授 (90431650)
上條 隆志  筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 准教授 (10301079)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード土壌微生物 / 三宅島2000年噴火 / 植生遷移 / エンドファイト / リボソームRNA遺伝子 / 微生物遷移 / 荒廃地再生
研究概要

本研究は、三宅島2000年噴火後の土壌生態系を調査対象として、火山ガスの噴出量減少にともない火山ガスで抑えられていた植生回復が一気に進むと考えられるこの数年間に起こる土壌微生物生態系変化の様態を解析し、新生火山灰から始まる土壌形成の初期過程における微生物の役割と植物-微生物間の相互作用を明らかにすることを目的とするものである.平成24年度は,火山ガスの影響を強く受けてきた地点(OY地点)と火山ガスの影響が比較的少なく,標高傾度に沿ってパッチ状の草本から低木林の段階に達する3地点(IG7,IG8,IG9地点)において,植生調査と火山灰堆積物および土壌の試料採取を2回(8月,3月)行った.採取した試料については、化学分析,リボソームRNA遺伝子のメタ解析(微生物群集解析),植物根共生糸状菌の分析,呼吸および窒素固定活性の測定を行った.その結果,OY地点の堆積物では,従属栄養代謝の微生物グループの割合が増加し,糸状菌ではTrichodermaのグループが優占することを観察した.このことは,従属栄養代謝が主体となる通常の土壌微生物群集に近づいていることを示唆する.また,IG7,IG8,IG9地点の堆積物では,植生遷移にともない,
β-Proteobacteriaとγ-Proteobacteriaからα-Proteobacteriaにシフトすること,糸状菌では,AscomycotaのグループからBasidiomycotaおよび未同定のグループにシフトすることを見出した.これは地上部の植物遷移に応答した土壌微生物の遷移と推察される.植物根共生糸状菌の解析では,Phialocephala属を含む根部エンドファイトがOY地点で採取した植物根で33%,IG7地点で24%の割合で存在することを観察した.この結果は,荒廃地への植物侵入における微生物の共生的役割を探る手がかりになるものと期待される.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

おおむね研究計画通りに、研究を実施した.また,その成果を学会等で発表した.なお,平成24年度の2回目の三宅島調査が平成25年3月になったが,平成25年度の5月までには,計画した採取試料の分析を終了する予定である.

今後の研究の推進方策

当初の計画通り,前述の調査地点での植物について,根圏微生物の分離同定を重点的に進めて,植生遷移と微生物群集の関係を解析する.また,堆積物については,硝化,脱窒等の窒素循環に関わる遺伝子の解析を行う.

次年度の研究費の使用計画

平成24年度の2回目の三宅島調査が平成25年3月になり,採取試料の分析の1部を,平成25年度に入って行っている.「直接経費次年度使用額」の経費は,その分析に当てる予定である.

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Leptospirillum ferrooxidans strain C2-3 isolated from fresh volcanic ash deposit on the island of Miyake, Japan2012

    • 著者名/発表者名
      R. Fujimura, Y. Sato, T. Nishizawa, K. Oshima, S.-W. Kim, M. Hattori, T. Kamijo, H. Ohta
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: 194 ページ: 4122-4123

    • DOI

      10.1128/JB.00696-12

    • 査読あり
  • [学会発表] 三宅島2000年噴火後の植生回復への菌類エンドファイトの関わりについて2012

    • 著者名/発表者名
      臼井絵里香, 太田寛行, 成澤才彦
    • 学会等名
      第28回日本微生物生態学会大会
    • 発表場所
      豊橋技術科学大学, 豊橋市
    • 年月日
      2012-09-20
  • [学会発表] メタゲノム解析から明らかにされた三宅島初成土壌微生物生態系の遷移2012

    • 著者名/発表者名
      藤村玲子, 金錫元, 佐藤嘉則, 須田亙, 西澤智康, 大島健志朗, 服部正平, 上條隆志, 太田寛行
    • 学会等名
      第28回日本微生物生態学会大会
    • 発表場所
      豊橋技術科学大学, 豊橋市
    • 年月日
      2012-09-20
  • [学会発表] Effect of vegetation cover on bacterial diversity of volcanic deposits in Miyake-jima, Japan2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Guo, R. Fujimura, Y. Sato, W. Suwata, K. Oshima, M. Hattori, T. Kamijo, H. Ohta
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2012年度鳥取大会
    • 発表場所
      鳥取大学, 鳥取市
    • 年月日
      2012-09-04
  • [学会発表] Bacterial community of the fresh volcanic deposits on barren land, grassland, and woodland in the Island of Miyake, Japan, as revealed by pyrosequencing-based analysis of 16S rRNA genes2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Guo, R. Fujimura, Y. Sato, K. Oshima, M. Hattori, T. Kamijo, H. Ohta
    • 学会等名
      14th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      ベラセンター, コペンハーゲン
    • 年月日
      2012-08-21
  • [学会発表] Metagenomic analysis of pioneer microbial community in young volcanic ash deposit on the island of Miyake, Japan.2012

    • 著者名/発表者名
      R.Fujimura, S.-W. Kim, Y. Sato, W. Suda, T. Nishizawa, K. Oshima, M. Hattori, T. Kamijo, H. Ohta
    • 学会等名
      14th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      ベラセンター, コペンハーゲン
    • 年月日
      2012-08-21

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公開日: 2014-07-16  

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