研究課題
APENXは以前に発表した新規タンパク質でAPエンドヌクレアーゼのPALFと良く似た性質を持つ。PARP1と結合しin vitroの実験ではノックをギャップに変えてPARP1を活性化させ単鎖切断の修復に必要なXRCC1とそれに集積するLIgaseIIIやAPTXなどの修復タンパク質を呼び寄せる。PALFとの違いを見つける事が重要であったが、APENXのノックダウン細胞では単鎖切断を作るMMSで細胞を処理した後のポリADPリボシル化が抑えられる事を発見した。また、MMSに対する感受性はAPENXをノックダウンした細胞では亢進していて、PARP1の活性化の阻害が細胞の感受性にも影響していることが明らかになった。このような影響はPALFでは見られず、PALFはKU蛋白の結合などで、DNA二重鎖切断の際に機能していることが考えられる。すなわち、PARP1と結合する異なった二つのタンパク質がDNAに切り込みを入れる活性とその末端を削って行く活性を持ちながら、PALFはPARP1以外に二重鎖切断の修復タンパク質と結合することで、機能の場を主に二重鎖切断の修復に関わっていることが明らかになった。APENXとPALFの相同組換えへの関与の違いも重要な点で、今後の研究課題である。
2: おおむね順調に進展している
研究実績に記述したAPENXとPALFの機能的差異やAPENXの単鎖切断修復でのPARPの活性化に関する成果に付いては論文を作成中であり、早々に投稿する予定である。相同組換えとの関係やクロマチンリモデリングとの関係の研究は進行中である。
単鎖切断の修復をPARPの阻害剤やAPENXのsiRNAで阻害させておき、MMSを細胞に処理した後に亢進する相同組換えの頻度を種々のクロマチンリモデリングに対するsiRNAでその影響を調べてどの因子が必要かを同定する。同定したタンパク質が細胞内でどのような複合体で機能しているかを知る為に、PARPの阻害剤+MMSで増殖している細胞から免疫沈降してこの応答特異的な結合タンパク質を決めて来る予定で去る。
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