研究課題
（1）100遺伝子座の配列決定用の追加材料として，インドネシア・マレーシアにおいて採集を行い，43種69サンプルをアルコール・冷凍保存した．（2）ショウジョウバエ（Drosophila）亜属のimmigrans-tripunctata系統群に属す種のうちで，特にオオショウジョウバエ種群のD. immigrans，D. albomicans，D. annulipes，D. quadrilineata，およびそれらに関連するD. funeburis，D. maculinotata，Scaptomyza gruminumの7種について，Roche 454 GS Jrシーケンサーを用い，種ごとに10～20万リードのcDNA配列を決定した．これらのデータをショウジョウバエ12ゲノムデータと合わせて系統解析を行ったところ，オオショウジョウバエ種群の多系統性が強く示唆された．（3）14種のシマショウジョウバエ（Sophophora）亜属の種について20遺伝子のPCR・配列決定を行い、ゲノム情報が明らかになっている18種のデータを合わせて分子系統解析をしている．（4）形態的にショウジョウバエ亜属との類縁が示唆されているものの，詳細な系統的位置がこれまで明らかにされていない，Hirtodrosphila属，Mycodrosophila属，Paramycodrosophila属，Zygothrica属，およびCollessia属を主な解析対象とし，合計5属26種について，28S，COI，およびCOII遺伝子の塩基配列を新たに決定した．（5）将来，DNA配列情報を使うことができない種を系統解析に含める際に，非常に有効と考えられる形態形質を使った「接木」解析（分子系統樹を鋳型として，形態形質に基づいて細部の枝の位置を決める）を，Siphlodora亜属の系統解析に適用し，充分に信頼性の高い結果を得た．
3: やや遅れている
（1）次世代シーケンサを用いる配列解析には，高度な実験技術とコンピュータを用いたデータ解析技術が必要なため，それらの修練のために思ったより時間がかかっている．（2）新規プライマーの開発に，当初の予想よりも時間を要しているため．
（1）26年度からIllumina MiSeqシーケンサーを用い，cDNAの解析の大きな効率アップを図る．そして，当初計画した50種を目標にcDNAの配列決定を行う．（2）上記のcDNA配列解読が進むことにより，100遺伝子の配列決定に有効なPCRプライマーの設計も容易になると考えられる．それにより，初年度に選定した約100種の候補種の100遺伝子座配列を決定することをめざす．（3）上記のデータに，公開されている12種のゲノム配列データを付け加えて，ショウジョウバエ科の骨格系統樹を求める．さらに，当初計画に従って，GenBankなどに登録されている数遺伝子座の配列データも組み込んだ網羅的巨大系統樹解析を行い，本研究の目的を達成する．
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