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2014 年度 実績報告書

3’から5’方向への鋳型依存RNA伸長反応を行う酵素Thg1の分子機構解明

研究課題

研究課題/領域番号 24370042
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 勲  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 特任教授 (70093052)

研究分担者 姚 閔  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 教授 (40311518)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワードX線結晶構造解析 / tRNA修飾 / アミノアシル合成酵素 / グアニン転移酵素 / 岡崎フラグメント / 鋳型依存伸長反応 / 逆向き重合
研究実績の概要

Thg1は,tRNA(His)の5'端にG塩基を付加する酵素であり,通常のDNA/RNAポリメラーゼと逆向きにRNAを伸長する能力を持つ.本研究ではThg1とtRNA(His)複合体のX線構造解析を行い,その構造をもとにThg1による逆向きの塩基伸長反応の分子機構の詳細を解明するとともに,通常の鋳型依存DNA/RNA伸長反応と本酵素の関係を明らかにして,鋳型依存DNA/RNA伸長反応の分子進化の謎に迫ることを目的としている.このために,真核生物型Thg1とtRNA(His)複合体(euThg1-tRNA(His)複合体)の立体構造解析を第一目標としながら,同時に原核生物型Thg1の単体およびtRNA(His)複合体の構造解析にも取り組み,最終的には両酵素の構造と反応機構を明らかにし,DNA/RNAポリメラーゼと比較することで,鋳型依存DNA/RNA合成の分子生物学の新しい展開を図ることを計画した.

原核生物型Thg1とtRNA(Phe)の複合体(proThg1-tRNA(Phe)複合体)の立体構造を分解能2.21Åで決定し,proThg1はtRNA(Phe)のアンチコドン部を認識せずに結合すること,アンチコドンをHisのものに変えたtRNA変異体に対しては,G-1付加型の結合に変わることを明らかにした.さらに活性部位にGTPホモログ(GDPNP)を挿入した反応中間体の構造も2.70Åの分解能で決定し,塩基部分はタンパク質と相互作用をしておらず,tRNAとワトソン・クリック型の塩基対を形成していることを明らかにした.これによりproThg1によるtRNA鋳型依存ヌクレオチド伸長機構を構造に基づいて説明することに成功した.3'-5'方向の合成反応の詳細を含め,現在,本研究で得られた成果を取りまとめた論文の準備中である.

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額が生じた理由

26年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額の使用計画

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2014 その他

すべて 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [学会発表] Thg1-likeタンパク質の機能構造解析(The functional and structural analysis of Thg1-like protein)2014

    • 著者名/発表者名
      木村匠子,鈴木干城,于健,薦田圭介,田中勲,姚閔
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
  • [学会発表] Structural analysis of tRNA(His) guanylyltransferase complexed with rRNA2014

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Nakamura, Taiki Nemoto, Isao Tanaka, Min Yao
    • 学会等名
      XXIII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2014)
    • 発表場所
      The Palais des congres de Montreal (Montreal, Canada)
    • 年月日
      2014-08-05 – 2014-08-12
  • [備考] 北海道大学 X線構造生物学研究室 ホームページ

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/

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公開日: 2016-06-01  

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