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2013 年度 実績報告書

リニアモータータンパク質糖質加水分解酵素の1ナノメートルステップの1分子計測

研究課題

研究課題/領域番号 24370062
研究機関東京大学

研究代表者

飯野 亮太  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (70403003)

研究分担者 五十嵐 圭日子  東京大学, 農学生命科学研究科, 准教授 (80345181)
内橋 貴之  金沢大学, 数物科学系, 准教授 (30326300)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード分子モーター / 1分子計測 / セルラーゼ / キチナーゼ
研究概要

セルロースやキチンを分解する糖類加水分解酵素であるセルラーゼやキチナーゼはリニアモータータンパク質であることが明らかにされており、レールとなる結晶性セルロースやキチンを加水分解する際に放出される化学エネルギーを利用して連続的に一方向に動く。本研究では、セルラーゼやキチナーゼを光学顕微鏡で1分子観察・操作して直進運動の素過程の可視化を行うとともに運動素過程の負荷依存性の計測により、その化学力学共役機構の詳細を明らかにする。
H25年度は、子嚢菌Trichoderma reesei由来のセルラーゼTrCel7Aのシステイン変異体を蛍光色素Cy3で修飾し、結晶性セルロース分解反応の1分子蛍光観察を行うことに成功した。これにより、結合速度定数、併進運動速度定数、解離速度定数をすべて求めることができた。特に、TrCel7Aの速度定数は結晶性セルロースIとIIIの分解反応でほぼ同じであり、生化学測定でみられるセルロースIとIIIの分解されやすさの大きな違いは、TrCel7Aの反応素過程の速度定数の差が原因ではなく、セルロースIとIIIの疎水性表面の割合の差によるものであることを明らかにした(Shibafuji et al JBC 2014)。
さらに、Serratia marcescens由来のキチナーゼChiAおよびChiBのシステイン変異体を多種作製し、蛍光標識及びビオチン標識でキチン分解活性を保持しているものをスクリーニングした。ChiAについては、1分子蛍光観察による運動測定に成功し、~50 nm/sという運動速度を求めることに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

1分子計測用のセルラーゼおよびキチナーゼの作製は完了した。セルラーゼTrCel7Aについては、1分子蛍光観察によりセルロース分解反応素過程の速度定数をすべて求めることに成功した。またTrCel6Aについても同様に速度定数の計測が進んでいる。またキチナーゼChiAについては、1分子蛍光観察による運動計測に成功した。

今後の研究の推進方策

今後は、ビオチン標識したセルラーゼ、キチナーゼを用い、ストレプトアビジン被覆金コロイドやポリスチレンビーズをプローブとして用いた高時空間分解能計測を行う。また、光ピンセットを用い、基質である結晶性多糖との結合力の測定や運動速度の負荷依存性の測定を行う。

次年度の研究費の使用計画

H25年度は1分子蛍光計測に注力したため、金コロイド微粒子やポリスチレンビーズの購入に充てる予定の予算を繰り越した。
プローブとして用いる金コロイド微粒子やポリスチレンビーズ、および試料調製用試薬の購入に用いる。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Single-molecule imaging analysis of elementary reaction steps of Trichoderma reesei cellobiohydrolase I (Cel7A) hydrolyzing crystalline cellulose Iα and IIII2014

    • 著者名/発表者名
      Shibafuji Y, Nakamura A, Uchihashi T, Sugimoto N, Fukuda S, Watanabe H, Samejima M, Ando T, Noji H, Koivula A, Igarashi K, Iino R
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 289 ページ: 14056-14065

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.546085

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] High-speed atomic force microscope combined with single-molecule fluorescence microscope2013

    • 著者名/発表者名
      Fukuda S, Uchihashi T, Iino R, Okazaki Y, Yoshida M, Igarashi K, Ando T
    • 雑誌名

      Review of Scientific Instruments

      巻: 84 ページ: 073706

    • DOI

      10.1063/1.4813280

    • 査読あり
  • [学会発表] Watching and manipulating biomolecules one at a time2014

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      PITTCON 2014
    • 発表場所
      米国、McCormick Place in Chicago, Illinois
    • 年月日
      20140302-20140305
    • 招待講演
  • [学会発表] 天然ナノモーターと人工ナノローターの1分子ダイナミクス2014

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      第三回 次世代の物質科学・ナノサイエンスを探る
    • 発表場所
      北海道、北海道大学百年記念会館
    • 年月日
      20140110-20140110
    • 招待講演
  • [学会発表] 金プローブで観た生体分子モーターの動き2013

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      新世代研究所 2013年度第1回バイオ単分子研究会
    • 発表場所
      岩手県、ホテル紫苑
    • 年月日
      20131110-20131110
  • [学会発表] Molecular mechanism of biological nanomachines probed by single-molecule techniques2013

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      12th International Conference on Atomically Controlled Surfaces, Interfaces and Nanostructures (ACSIN-12)
    • 発表場所
      茨城県、Tsukuba International Congress Center, Tsukuba
    • 年月日
      20131107-20131108
    • 招待講演
  • [学会発表] You can observe a lot just by watching motions of individual molecules2013

    • 著者名/発表者名
      Ryota Iino
    • 学会等名
      Japanese-German Frontiers of Science Symposium
    • 発表場所
      京都府、KYOTO BRIGHTON HOTEL
    • 年月日
      20131101-20131103
    • 招待講演
  • [学会発表] Single-molecule imaging analysis of cellobiohydrolase hydrolyzing crystalline cellulose2013

    • 著者名/発表者名
      Shibafuji Y, Nakamura A, Sugimoto N, Igarashi K, Fukuda S, Watanabe H, Uchihashi T, Noji H, Iino R
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      京都府、国立京都国際会館
    • 年月日
      20131028-20131030
  • [学会発表] 倒立型顕微鏡を用いたリアルタイム1分子イメージング:蛍光法と暗視野法2013

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      第51回生物物理学会年会 オリンパスランチョンセミナー
    • 発表場所
      京都府、国立京都国際会館
    • 年月日
      20131028-20131028
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体分子モーターの揺らぎと機能2013

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 学会等名
      国際高等研究所 「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」 第2回研究会
    • 発表場所
      京都府、国際高等研究所
    • 年月日
      20130809-20130809
    • 招待講演
  • [図書] DOJIN BIOSCIENCEシリーズ「揺らぎ・ダイナミクスと生体機能-物理化学的視点からみた生体分子-」Part III 機能とダイナミクス 第15章1節 モータータンパク質2013

    • 著者名/発表者名
      飯野亮太
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      化学同人

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公開日: 2015-05-28  

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