| 研究課題/領域番号 |
24370095
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
進化生物学
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| 研究機関 | 金沢大学 |
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研究代表者 |
西山 智明 金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
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| 研究分担者 |
坂山 英俊 神戸大学, 大学院理学研究科, 准教授 (60391108)
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| 研究協力者 |
宮田 大輔 神戸大学, 大学院理学研究科, 大学院生
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | シャジクモ / ストレプトファイツ類 / 全ゲノムシーケンス / 遺伝学的地図 |
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| 研究成果の概要 |
シャジクモ(Chara braunii)の概要ゲノム配列を解読した。シャジクモはストレプトファイツ類の中で陸上植物についで複雑な体制をもつ藻類であるシャジクモ類の中では小型の藻類で、実験室内で短時間に世代を完了する事が可能である。この概要ゲノム配列は、11,808本のスキャッフォールドからなり、35883遺伝子座上に36887個の遺伝子モデルが予測された。染色体スケールのスーパースキャッフォルドを得るため二つの系統間の交配を行い、子孫が外交配によっている事をSNPにもとづいて設計したPCR-RFLPによって同定した。この子孫株について遺伝学的地図を作成するためのランダムシーケンスを行った。
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| 自由記述の分野 |
進化学
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