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自家不和合性は、雌ずい側因子がS-RNaseであるRNase型が最も進化的起源が古く、様々な分類群に広く分布しているとされている。バラ科においてはサクラ連（オウトウなど）では単一の花粉側因子SFBが自己S-RNaseを認識する「単因子自己認識型」を示すが、興味深いことに我々は、ナシ連（ナシ、リンゴ）では複数の花粉側因子SFBBが非自己のS-RNaseを認識する「多因子非自己認識型」を示すことを見出したが、これら2タイプは分子レベルでどのように異なり、なぜバラ科に共存しているのかは不明である。本研究では、ナシ連の「多因子非自己認識型」機構に関与する因子の特定と機能解析を進め「単因子自己認識型」との異同の分子基盤と、バラ科におけるこれらの2タイプの進化的関係を解明することを目的として研究を行った。
リンゴのS遺伝子座の構造解析により多数の花粉側S因子SFBBの存在が知られていたが、その相対的配置はハプロタイプ間で異なっていることを見出した。このハプロタイプに固有の構造は、S遺伝子座での組換えを抑制し自家不和合性機構を維持する意義がある可能性が考えられた。
リンゴSFBBタンパク質と相互作用するタンパク質として、SBP1とSSK1を見出した。相互作用の強度と発現解析の結果から、花粉内ではSFBBはSSK1と主に複合体を形成し、機能しているものと考えられた。
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