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2014 年度 実績報告書

偽遺伝子挿入による種特異的非コードRNA獲得に基づく遺伝子スイッチ制御の多様化

研究課題

研究課題/領域番号 24380158
研究機関九州大学

研究代表者

今村 拓也  九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (90390682)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード進化 / エピゲノム / ノンコーディング / 霊長類 / 生物多様性 / 非コードRNA / DNAメチル化 / 次世代シーケンサー
研究実績の概要

本課題では、脳の動物種間多様性成立機構を解き明かすため、非タンパク質コードRNA(ncRNA)獲得と機能化が近傍遺伝子の発現スイッチを多様化しうる、という独自の発見の普遍性を検証した。昨年度までに、pancRNAと命名した遺伝子プロモーター近傍から発現するncRNAの新種を1000以上発見し、遺伝子活性化に働くこと及びその配列上の特徴を示し、うち複数の種特異的pancRNAについて機能解析を進めてきていた。今年度は、pancRNA発現の種間多様性を調べるために、哺乳類5種(チンパンジー・マカクザル・マーモセット・マウス・ラット)の5組織を用いた比較トランスクリプトーム解析を実施し、格段に包括度を増すことによる種特異的pancRNAの特徴の抽出と機能性検定を行った。その結果、pancRNAは発現プロファイルと塩基配列の点で種間多様性が高いということ、及び、数百の生物種特異的pancRNAが確かに存在していることを証明した。また、マウス大脳皮質特異的発現を示すpancRNAの機能解析から、実際に種特異的pancRNAが遺伝子発現制御に寄与し、表現型発現に結びついていることを示した。例えば、大脳においてげっ歯類にのみ認めたSh3rf3とVwa5b2遺伝子のpancRNA(pancSh3rf3、pancVwa5b2)については、pancSh3rf3が神経幹細胞におけるニューロン分化の促進に寄与すること、反対にpancVwa5b2が神経幹細胞におけるニューロン分化の抑制し、またアストロサイト分化の促進にも関与していること、を発見した。
以上より、種特異的なpancRNAレパートリーが存在し、それらが哺乳類生物種間で共通の遺伝子発現活性化機構を駆動することで、種特異的な遺伝子発現制御ネットワークを作り出している、という種間多様性発現機構が進化の過程で機能してきたことを提唱する。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額が生じた理由

26年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額の使用計画

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Gene activation-associated long noncoding RNAs function in mouse preimplantation development.2015

    • 著者名/発表者名
      Nobuhiko Hamazaki, Masahiro Uesaka, Kinichi Nakashima, Kiyokazu Agata, Takuya Imamura
    • 雑誌名

      Development

      巻: 142 ページ: 910-920

    • DOI

      10.1242/dev.116996

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of hypothalamic arcuate nucleus-specific enhancer region of kiss1 gene in mice.2015

    • 著者名/発表者名
      Teppei Goto, Junko Tomikawa, Kana Ikegami, Shiori Minabe, Hitomi Abe, Tatsuya Fukanuma, Takuya Imamura, Kenji Takase, Makoto Sanbo, Koichi Tomita, Masumi Hirabayashi, Kei-ichiro Maeda, Hiroko Tsukamura, Yoshihisa Uenoyama.
    • 雑誌名

      Molecular Endocrinology

      巻: 29 ページ: 121-129

    • DOI

      10.1210/me.2014-1289

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epigenetic setting and reprogramming for neural cell fate determination and differentiation.2014

    • 著者名/発表者名
      Takuya Imamura, Masahiro Uesaka, Kinichi Nakashima
    • 雑誌名

      Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B

      巻: 369 ページ: 1652

    • DOI

      10.1098/rstb.2013.0511

    • 査読あり
  • [学会発表] Bidirectional promoter-derived antisense noncoding RNA epigenetically regulates irreversible differentiation of PC12 cells2015

    • 著者名/発表者名
      Naoki Yamamoto, Kiyokazu Agata, Kinichi Nakashima, Takuya Imamura
    • 学会等名
      第8回神経発生討論会
    • 発表場所
      九州大学病院キャンパス(福岡市)
    • 年月日
      2015-03-19 – 2015-03-20
  • [学会発表] Species-specific repertories of promoter-associated non-coding RNAs may contribute to the diversification of gene expression profile2015

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Uesaka, Kiyokazu Agata, Kinichi Nakashima, Takuya Imamura
    • 学会等名
      第8回神経発生討論会
    • 発表場所
      九州大学病院キャンパス(福岡市)
    • 年月日
      2015-03-19 – 2015-03-20
  • [学会発表] 長鎖ncRNAによるほ乳類エピゲノム制御2014

    • 著者名/発表者名
      今村拓也
    • 学会等名
      第157回日本獣医学会学術集会
    • 発表場所
      北海道大学高等教育推進機構(札幌市)
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-12
  • [学会発表] マウス初期胚の全能性を支える遺伝子を活性化するノンコーディングRNAの同定2014

    • 著者名/発表者名
      濵崎伸彦, 上坂将弘, 中島欽一, 阿形清和, 今村拓也
    • 学会等名
      第107回日本繁殖生物学会大会
    • 発表場所
      帯広畜産大学(帯広市)
    • 年月日
      2014-08-21 – 2014-08-24
  • [学会発表] Potential role for species-specific promoter-associated non-coding RNAs in the diversification of mammalian brain2014

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Uesaka, Osamu Nishimura, Kinichi Nakashima, Kiyokazu Agata, Takuya Imamura
    • 学会等名
      第47回日本発生生物学会年会
    • 発表場所
      ウインクあいち(名古屋市)
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
  • [学会発表] Promoter-associated noncoding RNAs mediate gene-specific DNA demethylation for mouse preimplantation development2014

    • 著者名/発表者名
      Nobuhiko Hamazaki, Masahiro Uesaka, Kinichi Nakashima, Kiyokazu Agata, Takuya Imamura
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      伊藤国際学術研究センター(東京都文京区)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
  • [学会発表] PC12細胞分化過程におけるエピジェネティック制御に関わる promoter-associated noncoding RNAの機能2014

    • 著者名/発表者名
      山本直樹、上坂将弘、中島欽一、阿形清和、今村拓也
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      伊藤国際学術研究センター(東京都文京区)
    • 年月日
      2014-05-25 – 2014-05-27
  • [図書] Roles of Epigenetics in the Neural Stem Cell and Neuron: In: J. Peedicayil, D. Grayson, D. Avramopoulos (eds), ISBN 9780124171145 Epigenetics in Psychiatry2014

    • 著者名/発表者名
      Naoki Yamamoto, Masahiro Uesaka, Takuya Imamura, Kinichi Nakashima
    • 総ページ数
      664
    • 出版者
      Elsevier
  • [備考] 九大プレスリリース

    • URL

      http://www.kyushu-u.ac.jp/pressrelease/2015/2015_02_05.pdf

  • [備考] 九大医学研究院HP

    • URL

      http://www.med.kyushu-u.ac.jp/app/modules/information/detail.php?i=753&c=10

  • [備考] 九大医学系学府HP

    • URL

      http://www.grad.med.kyushu-u.ac.jp/researchinfo/detail.php?i=753

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公開日: 2016-06-01  

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