| 研究課題/領域番号 |
24390030
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| 研究機関 | 千葉大学 |
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研究代表者 |
齊藤 和季 千葉大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (00146705)
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| 研究分担者 |
吉本 尚子 千葉大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (10415333)
山崎 真巳 千葉大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (70222370)
鈴木 秀幸 公益財団法人かずさDNA研究所, バイオ研究開発部, 主席研究員 (80276162)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| キーワード | 薬用資源 / トランスクリプトーム / メタボローム / 二次代謝 |
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| 研究実績の概要 |
次世代DNAシークエンサーやメタボロミクス解析の技術進展により、統合オミクスを駆使した植物ゲノム機能科学が注目されている。特に、植物など植物の有用性を決めているのは、植物に特徴的な代謝産物であり、植物の有する化学的多様性のゲノム基盤解明とその応用は地球規模での諸問題解決のために極めて重要である。植物代謝産物の植物化学的多様性のゲノム基盤解明と応用（ファンクショナルファイトケミカルゲノミクス）は、植物遺伝子資源の有効利用にとって重要かつ急務である。
そこで本研究では、日本で生育する代表的な薬用植物のディープ・トランスクリプトーム解析を次世代DNAシークエンサーを用いて行い、薬用二次代謝産物と可能ならばその生合成中間体に関する代謝産物データを取得する。このトランスクリプトームとメタボロームの統合解析によって、これらの重要な薬用植物の化学的多様性を決めている鍵遺伝子と遺伝子－代謝産物の関係を推定する。本年度は、昨年度から継続して日本で生育可能な代表的な薬用植物についてRNAを調整し、ディープ・トランスクリプトーム(RNASeq)データ取得を行った。配列データ取得はイルミナ社のHiSeqシステムを用いて、断片化したcDNAクローンを両端から配列を解読した。その後、重要なマメ科の生薬基原植物であるクララ(Sophora flavescens)とクズ(Pueraria lobata)のトランスクリプトームデータについて複数の手法を用いてアセンブルを行い、アセンブルしたデータについて、機能アノテーション、遺伝子オントロジー解析、発現パターン解析、KEGGマップへの投影などを継続して行った。その結果、生薬成分の生合成に関する複数の遺伝子が推定できた。絞り込んだ少数の遺伝子については定量的PCRによってその遺伝子発現パターンを明らかにし、部分的な有効成分解析も行って、遺伝子機能について、より詳細を解明を行った。
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| 現在までの達成度 (段落) |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額の使用計画 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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