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遺伝子機能は基本的にはゲノムDNAからmRNAへ転写され、その後、蛋白質へ翻訳されて機能分子となることで達成されている。近年の研究では、非コードRNAの存在が注目され、その典型的な例としてRNA干渉という現象が良く知られており、また、生命科学実験で多用されるに至っている。RNA干渉は、二本鎖RNAが細胞に入ると、同じ配列のmRNAを分解する現象である。線虫を用いた研究で発見されたが、その当初から特定の細胞で起こると細胞間を伝播し、別の細胞の同じ遺伝子のmRNAを分解することで全身性の作用に至ることが知られていた。これをsystemic RNAiと呼んでいる。線虫では、特に顕著であるが、哺乳類細胞でも類似の現象が観察されている。我々は、線虫を用いてsystemic RNAiに異常が起こる遺伝子のスクリーニングを行った。小胞輸送関連の分子の変異体にfeeding RNAiを行い、RNAiに抵抗性の変異体を見出した。スクリーニングに使用した変異体遺伝子としては、ctbp-1と呼ばれる遺伝子であったが、レスキュー実験を行った結果、実際の表現型を呈しているのは別の変異であることが疑われた。そこで、該当ストレインよりゲノムDNAを抽出し、Ion Torrentという次世代シーケンサーで変異体の全ゲノムシーケンス解析を行った。その結果、rsd-3と呼ばれる遺伝子に欠失が入っていることが分かった。rsd-3の欠失変異体の追加の欠失変異体で同一の表現型を呈したこと、スクリーニングに使用した株の分離後、ctbp-1変異には表現型がなく、rsd-3変異には表現型があったこと、rsd-3のトランスジェニックによりこの変異の表現型が回復したことから、原因遺伝子はrsd-3である。RSD-3の局在は、TGNおよびエンドソームであることなどを記載し、論文を投稿中である。
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