エクソーム解析による小児喘息発症の個別化医療と創薬のための分子標的遺伝子の探索

2015 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 24390251
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 野口 恵美子 筑波大学, 医学医療系, 教授 (40344882)
• 研究分担者: 岡村 浩司 国立研究開発法人国立成育医療研究センター, システム発生・再生医学研究部, 室長 (80456194)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: 気管支喘息 / エクソーム

研究実績の概要

アレルギーを含む多因子疾患において、近年複数の稀な遺伝子変異が疾患発症に強い影響を持つことが明らかとなり、これらの稀な変異により喘息の強い遺伝率を説明することができると考えられている。
申請者はアレルギー疾患の遺伝要因の解明を目的に遺伝子多型および網羅的遺伝子発現解析を通して病態の解明を行ってきた。本研究では喘息発症に強い影響を与えるレアバリアントを同定する目的で次世代シークエンサーを用いたエクソーム解析を行った。
プラットフォームとしてSOLiD5500, illumina、解析プラットフォームとしてはBroad InstituteのGenome Analysis Toolkit(GATK)を使用して、難治性ぜんそく患者を含む70名のエクソーム解析が終了した。また、コントロールとしては1000 Genome Project Phase Iの日本人エクソームサンプル89サンプルを使用した。複数の候補遺伝子変異が同定されており、現在は２次解析のための候補遺伝子変異のバリデーションを行っている。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Variants near the HLA complex group 22 gene (HCG22) confer increased susceptibility to late-onset asthma in Japanese populations. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yatagai Y, Hirota T, Sakamoto T, Yamada H, Masuko H, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Noguchi E, Tamari M, Kubo M, Takahashi A, Konno S, Makita H, Nishimura M, Hijikata M, Keicho N, Homma S, Taguchi Y, Azuma A, Kudoh S, Hizawa N
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol. 巻: in press ページ: in press
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2015.11.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of Lung Function Genes in the Development of Asthma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yamada H, Masuko H, Yatagai Y, Sakamoto T, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Noguchi E, Konno S, Nishimura M, Hirota T, Tamari M, Hizawa N
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 11 ページ: e0145832
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0145832
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification and Characterization of CD300H, a New Member of the Human CD300 Immunoreceptor Family. (2015)
  • 著者名/発表者名: Niizuma K, Tahara-Hanaoka S, Noguchi E, Shibuya A
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 290 ページ: 22298-308
  • DOI: 10.1074/jbc.M115.643361
  • 査読あり
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたゲノム解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 第64回日本アレルギー学会学術大会
  • 発表場所: 東京 グランドプリンスホテル新高輪
  • 年月日: 2015-05-27 – 2015-05-27
  • 招待講演