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2013 年度 実績報告書

脳悪性リンパ腫の全エクソンシーケンスを応用したゲノム創薬・バイオマーカー研究

研究課題

研究課題/領域番号 24390347
研究機関京都府立医科大学

研究代表者

山中 龍也  京都府立医科大学, 医学部, 教授 (20323991)

研究分担者 池中 一裕  生理学研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (00144527)
川口 淳  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (60389319)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
キーワード脳腫瘍 / 中枢神経原発悪性リンパ腫 / エクソーム解析 / 遺伝子発現 / miRNA / 薬剤耐性
研究概要

中枢神経原発悪性リンパ腫50症例の凍結組織サンプルのゲノム解析データを基盤とし、幹細胞、薬剤耐性細胞株を樹立し (1)遺伝子発現情報、 (2) microRNA、(3)次世代シーケンサーを用いた全エクソン解析を行い統合的な統計解析を進めin vitro, in vivoの実験後にバイオマーカー、治療標的遺伝子を選択し、さらに創薬に向けた研究を展開する事を目標に研究を継続している。
現在まで、枢神経原発悪性リンパ腫腫瘍組織と末梢血正常リンパ球を次世代シーケンサーを用いた全エクソン解析がほぼ終了し、情報解析中である。また、mRNA, miRNAの解析から患者の予後と相関する分子を選択し、in vitro, in vivoの確認実験中である。mRNAに関しては、マイクロアレイのデータから発現レベルと患者の生存日数とをRadom survival forest法を用いて解析を行い、患者の生存と相関のある25の遺伝子を選択し、それらの遺伝子の発現値を用いた予後予測式を考案した。 さらに、25種類の遺伝子の中から3種類を選択して、簡便な予後予測式も考案した。miRNAに関しても、同様な方法で19種類の分子を選択し、さらに3種類の分子を用いた簡便式を考案した。以上の、選択されたmRNA, miRNAを培養腫瘍細胞に導入し、細胞増殖能、薬剤耐性の変化などについて実験中である。また、中枢神経原発悪性リンパ腫細胞株を用いてMTX薬剤耐性細胞株を樹立しつつあり、そのmRNA, miRNAの発現プロファイルの特徴につき検討を進める予定でいる。
以上の、研究結果を統合し、疾患特異的なバイオマーカー、治療標的遺伝子を選択し、創薬に向けた研究を展開する予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

当初の予定では、エクソーム解析を終了し、情報解析まで終了している予定であった。

今後の研究の推進方策

エクソーム解析を終了し、情報解析まで終了する。mRNA,miRNAのin vitroの実験を終了し、また薬剤耐性株の遺伝子発現プロファイル解析を進める。以上から、統合的な解析を進め、標的分子の選択を行う。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Non-deep-seated primary CNS lymphoma – therapeutic responses and a molecular signature2014

    • 著者名/発表者名
      Iwadate Y, Suganami A, Ikegami S, Shinozaki N, Matsutani T, Tamura Y, Saeki N, Yamanaka R
    • 雑誌名

      J Neurooncol

      巻: 117 ページ: 261-268

    • DOI

      10.1007/s11060-014-1379-4.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene expression signature-based prognostic risk score in patients with glioblastoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi A, Yajima N, Tsuchiya N, Homma J, Sano M, Natsumeda M, Takahashi H, Fujii Y, Kakuma T, Yamanaka R
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 104 ページ: 1205-1210

    • DOI

      10.1111/cas.12214

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phase II study of personalized peptide vaccination for refractory bone and soft tissue sarcoma patients.2013

    • 著者名/発表者名
      Takahashi R, Ishibashi Y, Hiraoka K, Matsueda S, Kawano K, Kawahara A, Kage M, Ohshima K, Yamanaka R, Shichijo S, Shirouzu K, Itoh K, Sasada T.
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 104 ページ: 1285-1294

    • DOI

      10.1111/cas.12226

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Radiation-Induced Glioblastoma Following Radiotherapy for Pituitary Adenomas: Marked Response to Chemotherapy.2013

    • 著者名/発表者名
      Kon T, Natsumeda M, Takahashi H, Taki T,Fujii Y, Yamanaka R
    • 雑誌名

      J Neurol Neurophysiol

      巻: 4 ページ: 155

    • DOI

      doi:10.4172/2155-9562.1000155

    • 査読あり
  • [学会発表] 悪性星細胞腫瘍の遺伝子発現プロファイルによる予後予測方の検討2013

    • 著者名/発表者名
      山中龍也、森吉英子、川口淳、藤井幸彦、角間辰行
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20131003-20131005
  • [学会発表] 悪性星細胞腫瘍患者の予後予測方法の探索2013

    • 著者名/発表者名
      山中龍也、川口淳、藤井幸彦、角間辰行
    • 学会等名
      第11回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20130829-20130831
  • [備考] 京都府立医科大学大学院保健看護学研究科医学講座

    • URL

      http://www.f.kpu-m.ac.jp/c/kouza/igaku/

  • [産業財産権] 悪性神経膠腫Grade4患者の予後予測方法及びキット2013

    • 発明者名
      山中龍也、藤井幸彦、角間辰之、川口淳
    • 権利者名
      山中龍也、藤井幸彦、角間辰之、川口淳
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2013-124686
    • 出願年月日
      2013-06-13

URL: 

公開日: 2015-05-28  

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