シークエンスに基づく比較トランスクリプトーム解析のためのガイドライン構築

2014 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24500359
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 門田 幸二 東京大学, 農学生命科学研究科, 特任准教授 (60392221)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: バイオインフォマティクス / トランスクリプトーム / RNA-seq / 正規化 / 発現変動

研究成果の概要

RNA-seqは、生体内で発現しているRNA（トランスクリプトーム）を網羅的に調べる次世代の実験技術である。本研究では、旧世代ではあるものの成熟した実験技術であるマイクロアレイ用に開発された手法や知見をもとに、RNA-seqデータ解析精度向上を目指し研究を行った。得られたガイドラインや知見を手軽に利用できるよう、ウェブサイト上で公開するとともに、体系的にまとめた書籍を刊行した。

自由記述の分野

バイオインフォマティクス