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2014 年度 研究成果報告書

超離散時空間解析と大規模配列解析の融合による遺伝子転写原理の解明

研究課題

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研究課題/領域番号 24500360
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生体生命情報学
研究機関東京大学

研究代表者

大田 佳宏  東京大学, 数理(科)学研究科(研究院), 特任教授 (80436592)

研究分担者 井原 茂男  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任教授 (30345136)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード超離散 / 配列解析 / 遺伝子転写
研究成果の概要

ヒト細胞を用いたRNAPII (RNA polymerase II) 実体の運動情報やエピジェネティック修飾情報の数理解析の研究を行った。これまでの我々の研究では、時間分解能7.5分間隔で細胞実験を行っていたが、本研究課題ではより高い時間分解能の転写におけるRNAデータの取得を行った。さらに、転写ダイナミクスを制御しその運動にも影響を与える因子として、各種タンパク質結合情報とエピジェネティック修飾情報も取得した。これらの細胞実験のデータをもとに、データマイニングの技術を応用し、転写の運動・修飾情報を染色体上の数値データとしてパスプリファレンスを含めた数理解析を行うプログラムを開発した。

自由記述の分野

数理生物学

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公開日: 2016-06-03  

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