研究実績の概要 |
ポリヒドロキシブタン酸は微生物によって作られまた分解される、R体3-ヒドロキシブタン酸をモノマーユニットとする水不溶性の生分解性脂肪族ポリエステルである。ポリヒドロキシブタン酸分解酵素はポリヒドロキシブタン酸をモノマーユニット単量体または二量体にまで加水分解する。多くのポリヒドロキシブタン酸分解酵素は触媒ドメイン、リンカードメイン、ポリマー結合ドメインの3つのドメインから成る。これまでに Ralstonia pickettii T1 由来酵素の結晶化、X線構造解析を行い、319残基から成る触媒ドメインの結晶構造を明らかにしている。触媒ドメインは α/β hydroase fold と呼ばれる構造的特徴を持ち、Ser-166, Asp-241, His-300が触媒部位を構成していた。本年度は本酵素のS166A変異体と4量体基質を用いて酵素ー基質複合体の構造を分解能 1.6 A において明らかにした。さらにこれまで不明であったリンカードメインの結晶構造も初めて明らかにした。4量体基質の連続した3量体部分のモデルを構築することができ、酵素のサブサイトS1、S2、S-1における結合様式を明らかにすることが出来た。酵素のサブサイトS2における結合様式は、すでに酵素―基質複合体の結晶構造を明らかにしている Penicilium funicullosum 由来酵素におけるそれとは大きく異なっていた。サブサイトS-1における結合様式は本研究成果によって初めて明らかにされた。リンカードメインの構造はバチルス属由来キチナーゼA1のフィブロネクチン・タイプ3様ドメインとよく似ていた。触媒ドメインとリンカードメインをつなぐ領域は非常にフレキシブルな運動性を持っていた。これらの成果は、ポリヒドロキシブタン酸分解酵素の機能改変を行う上で重要な情報であり、バイオポリエステル・エンジニアリングの発展に大きく寄与する。
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