本研究では、各モデル生物において、細胞分化・器官形成など時間経過とともに形態変化を起こし異なったステージへの移行を決定する細胞内因子を推定し、細胞分化プロセスをネットワークモデルとして解析を行った。 具体的には、構造方程式モデリングを軸とし、因子分析やクラスタリングなどその他の統計解析と組み合わせた新規ネットワーク推定手法を開発した。さらに開発した手法を、出芽酵母・線虫・ショウジョウバエ・ES細胞やiPS細胞などの様々なモデル生物で測定された遺伝子発現プロファイルに適用した。その結果、細胞分化プロセスで必要とされる遺伝子発現の細胞内制御因子候補を推定し、その制御機構をネットワークモデルとした。
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