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ワサビとユリワサビが同所的に生育している集団では、かなりの頻度で中間的な形態を持つ個体が存在する。全国のワサビ属植物の地域集団間の遺伝的類縁関係を葉緑体DNAの塩基配列比較から明らかにしたところ、ユリワサビではある程度地理的な位置関係と系統関係が一致していたものの、地理的な関係を反映しない系統も数多く存在していた。交雑個体と考えられる個体はワサビ型のDNAを持ち、中間体の形成は常にワサビを母系とするという当初の仮説が支持された。また、交雑由来と考えられる個体の形態の多様性を顕微鏡で調べたところ、中間型の変異の幅が非常に大きいことがわかり、栽培種よる野生集団の遺伝的攪乱の可能性が示された。
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