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2014 年度 実績報告書

終止コドン非依存的翻訳終結の分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 24570008
研究機関岡山大学

研究代表者

阿保 達彦  岡山大学, 自然科学研究科, 准教授 (90303601)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワードArfA / RF2 / 翻訳 / リボソーム / バクテリア / 大腸菌 / mRNA
研究実績の概要

前年度までに大腸菌リボソーム解放因子ArfAによるNTC(non-productive translational complex)解消にRF2が必要とされることを明らかにし,さらに,ArfAと相互作用するリボソームタンパク質の探索,ArfAとリボソームとの相互作用に重要な残基の特定を目指した解析を行った。本年度,ArfAに対するアミノ酸残基置換導入がArfAのリボソーム結合能,及びリボソーム解放能に与える影響をより詳細に解析したところ,ArfAに特徴的な塩基性アミノ酸残基クラスターの正荷電がリボソームとの結合に重要であることを示す結果を得た。また,リボソームのA及びPサイト近傍に存在するリボソームタンパク質S9とArfAとの相互作用も観察された。さらに,Fe-BABEを用いたラジカルプロービング法により,結合状態におけるArfAとリボソームの相対的位置関係の解析を行ったところ,人工的に再現したNTC中のリボソーム上,mRNA結合部位に相当する領域にArfAが存在すること,また,その結合状態がRF2の有無により変化することが明らかとなった。ArfAとRF2とは直接相互作用せず,リボソームを介してのみ挙動を一にした。これらの結果は,これまでに提唱していたモデル,すなわちArfAがNTC中のリボソームの空のAサイトを認識・結合し,おそらくはリボソームのコンフォメーションを変化させることでRF2をリクルートするという機構に合致するものである。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kurita, Yuhei Chadani, Akira Muto, Tatsuhiko Abo and Hyouta Himeno
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 42 ページ: 13339-13352

    • DOI

      10.1093/nar/gku1069

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Ribosome rescue systems in bacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Himeno H, Nameki N, Kurita D, Muto A, Abo T
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: S0300-9084 ページ: 00355-1

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2014.11.014

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The fail-safe system to rescue the stalled ribosomes in Escherichia coli2014

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiko Abo and Yuhei Chadani
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 5 ページ: 156

    • DOI

      10.3389/fmicb.2014.00156

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 大腸菌ArfAタンパク質アミノ酸置換変異体とリボソームとの相互作用2015

    • 著者名/発表者名
      阿保達彦
    • 学会等名
      第3回リボソームミーティング
    • 発表場所
      宮崎市
    • 年月日
      2015-03-17 – 2015-03-18
  • [学会発表] 大腸菌リボソーム解放因子ArfAアミノ酸置換変異体の解析2014

    • 著者名/発表者名
      森木省伍,花房賢,天野剛志,廣明秀一,阿保達彦
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      長浜市
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
  • [学会発表] 大腸菌ArfAタンパク質のリボソーム結合能2014

    • 著者名/発表者名
      阿保 達彦、茶谷 悠平、柴谷知宏、大川成美
    • 学会等名
      第16回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2014-07-23 – 2014-07-24

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公開日: 2016-06-01  

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