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2012 年度 実施状況報告書

光照射固体NMRを駆使したレチナール異性化と光受容膜タンパク質の構造変化の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24570127
研究種目

基盤研究(C)

研究機関横浜国立大学

研究代表者

川村 出  横浜国立大学, 工学研究院, 助教 (20452047)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード固体NMR / 膜タンパク質 / レチナール / ダイナミクス / 立体構造
研究概要

本研究では固体NMR分光法を用いて、光受容膜タンパク質の構造解析を行うことが目的であり、本年度は以下のような成果が得られた。
1. 固体NMRの高速MAS法による試料への圧力効果を利用して、光駆動型プロトンポンプ機能をもつバクテリオロドプシンのレチナールを13-cis型へ異性化させ、その場合でのタンパク質構造変化を観測し、レチナール近傍のアミノ酸残基(Ala81, Ala84)で運動性が上昇することが明らかとなった。これによりタンパク質の構造変化を伴って13-cis型レチナールへ異性化することが示唆され、大きな体積減少に関わっていると考えられる。
2. 光照射固体NMRをさらに改良し、走光性を司るセンサリーロドプシンIに対してIn-situ光照射-固体NMRによる実験を行った。特に2波長の光を利用して、その光反応を化学シフトで区別して詳細に解析した。その結果、測定中にレチナールの光異性化反応を引き起こすことに成功し、機能に重要な光中間体を捕捉することに成功した。
3. 高磁場固体高分解能NMR法を用いて、細胞膜中で三量体構造を形成しているアナベナセンサリーロドプシンの立体構造解析を試みた。[1,3-13C]glycerolおよび[2-13C]glycerolを用いて試料を調製し、分子間の距離情報や化学シフト値情報などを獲得して構造計算を行った。それにより、細胞膜中で三量体を形成している状態でアナベナセンサリーロドプシンの立体構造を決定した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

高分解能固体NMR法の標準的な手法としてマジック角回転MAS法があり、この手法を用いながら、試料管に入れた試料を光励起するIn-situ光照射-固体NMRを主に使用している。これを用いてセンサリーロドプシンIがもつレチナールの光異性化反応を固体NMR測定中に観測することに成功した。同時に、測定中に光の波長を容易に切替えることができるLED光源を設置し、多波長での光反応実験を行うことも可能とした。これにより、センサリーロドプシンIの正および負の走光性に関わる中間体を観測し、これらをレチナールの化学シフト値によって区別することができた。このように本研究課題で主に使用する手法を用いて、興味深い結果が得られたため、順調に研究が進展している。

今後の研究の推進方策

光照射-固体NMRによって、反応中心であるレチナールの光異性化を観測することに成功したので、今後はそれを取り囲むタンパク質構造の変化を捉え、光活性メカニズムに関する構造情報を集める。また、変異体や細胞膜の成分を変えてタンパク質の変化を観測する予定である。

次年度の研究費の使用計画

該当なし

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Grafting of paired 3-aminopropyltrialkoxy silanes onto mesoporous silica and adsorptions of isomers of benzenedialdehydes2013

    • 著者名/発表者名
      H. Yoshitake*, T. Koizumi, I. Kawamura, A. Naito
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 15 ページ: 3946-3954

    • DOI

      10.1039/C3CP44592E

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of Amorphized Zeolite A by Combining High-Energy X-ray Diffraction and High-Resolution Transmission Electron Microscopy2012

    • 著者名/発表者名
      K. Sato, T. Wakihara*, S. Kohara, K. Ohara, J. Tatami, A. Endo, S. Inagaki, I. Kawamura, A. Naito, Y. Kubota
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. C

      巻: 116 ページ: 25293-25299

    • DOI

      10.1021/jp305359q

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and Orientation of Bovine Lactoferrampin in the Mimetic Bacterial Membrane as Revealed by Solid-State NMR and Molecular Dynamics Simulation2012

    • 著者名/発表者名
      A. Tsutsumi, N. Javkhlantugs, A. Kira, M. Umeyama, I. Kawamura, K. Nishimura, K. Ueda, A. Naito*
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 103 ページ: 1735-1743

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.09.010

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Change in Local Dynamics of Bacteriorhodopsin with Retinal Isomerization under Pressure as Studied by Fast Magic Angle Spinning NMR2012

    • 著者名/発表者名
      I. Kawamura*, S. Yamaguchi, H. Nishikawa, K. Tajima, M. Horigome, S. Tuzi, H. Saito, A. Naito
    • 雑誌名

      Polymer Journal

      巻: 44 ページ: 863-867

    • DOI

      10.1038/pj.2012.116

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 動的核分極DNPによる超高感度固体NMR法の生体分子への展開2012

    • 著者名/発表者名
      川村 出*、内藤 晶
    • 雑誌名

      分光研究

      巻: 61 ページ: 46-47

    • 査読あり
  • [学会発表] 固体NMRを用いた温度および圧力に対するバクテリオロドプシンの構造変化の解析2013

    • 著者名/発表者名
      ○川村 出、重田安里寿、堀籠 美也子、沖津貴志、和田昭盛、辻 暁、内藤 晶
    • 学会等名
      日本化学会 第93回 春季年会
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 年月日
      20130322-20130325
  • [学会発表] In-situマイクロ波照射NMRによる物質の非平衡加熱状態の観測2013

    • 著者名/発表者名
      ○田制侑悟、藤戸輝明、川村 出、内藤 晶
    • 学会等名
      日本化学会 第93回 春季年会
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 年月日
      20130322-20130325
  • [学会発表] 固体NMRを用いた圧力によるレチナール異性化とバクテリオロドプシンの構造および運動性変化の解析2012

    • 著者名/発表者名
      ○川村 出、西川大英、堀籠美也子、辻 暁、内藤 晶
    • 学会等名
      第85回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
    • 年月日
      20121214-20121216
  • [学会発表] 固体NMRを用いた温度および圧力に対するバクテリオロドプシンの構造変化の解析2012

    • 著者名/発表者名
      ○川村 出、内藤 晶
    • 学会等名
      第51回 NMR討論会
    • 発表場所
      ウインク愛知
    • 年月日
      20121110-20121112
  • [学会発表] Thermal and pressure effects on the structure and dynamics of bacteriorhodopsin as studied by solid-state NMR2012

    • 著者名/発表者名
      ○I. Kawamura, M. Horigome, H. Nishikawa, T. Okitsu, A. Wada, S. Tuzi, T. Iwasa, A. Naito
    • 学会等名
      15th International Conference on Retinal Proteins (ICRP2012)
    • 発表場所
      アスコナ、スイス
    • 年月日
      20120930-20121005
  • [学会発表] Thermal and pressure induced structural and dynamics changes of bacteriorhodopsin as studied by solid-state NMR2012

    • 著者名/発表者名
      I. Kwamura, M. Horigome, H. Nishikawa, K. Tajima, T. Okitsu, A. Wada, S. Tuzi, T. Iwasa, A. Naito.
    • 学会等名
      第50回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学 東山キャンパス
    • 年月日
      20120922-20120924
  • [学会発表] 固体高分解能NMRによる7本膜貫通型光受容膜タンパク質の細胞膜中での構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      ○川村 出
    • 学会等名
      平成24年度 日本生化学会関東支部例会
    • 発表場所
      群馬大学 医学部
    • 年月日
      20120623-20120623
  • [備考] 横浜国立大学 研究者総覧 川村 出

    • URL

      http://er-web.jmk.ynu.ac.jp/html/KAWAMURA_Izuru/ja.html

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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