2014 年度研究成果報告書

遺伝子細胞機能推定のための統合ネットワークの構築と解析

研究課題

研究課題/領域番号	24570176
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
研究分野	生物物理学
研究機関	東北大学
研究代表者	木下賢吾東北大学, 情報科学研究科, 教授 (60332293)
研究期間 (年度)	2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード	遺伝子共発現 / 蛋白質間相互作用 / 統合ネットワーク / 種間比較 / クラスター解析
研究成果の概要	既に数千種を超える生物種でゲノムの全配列が明らかにされているが、ゲノムにコードされている遺伝子の約半数は機能未知のままである。すべての遺伝子の可能な機能を実験で検証するのは到底不可能であり、計算科学的な手法により機能を推定し実験で検証を行う手法が不可欠である。本申請では、マイクロアレイやRNA-seqデータから得られる共発現情報と大規模なタンパク質間相互作用データを利用して、統合ネットワークの構築と種間比較を行い、新規のクラスタリング手法の開発と細胞機能の推定法の開発を行った。
自由記述の分野	生命情報科学