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2013 年度 実施状況報告書

機能未知F-boxタンパク質の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 24580152
研究機関公益財団法人東京都医学総合研究所

研究代表者

吉田 雪子  公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 主任研究員 (90271543)

キーワードユビキチンリガーゼ / F-boxタンパク質 / ユビキチン / プロテオミクス
研究概要

分解されるべき標的分子を見分けユビキチンを付加する酵素「ユビキチンリガーゼ」は、広範な生命現象の制御を担うユビキチン・プロテアソームシステムの要となる分子である。複合体型リガーゼとして知られるSCF型ユビキチンリガーゼの基質認識サブユニットF-boxタンパク質はヒトでは約70種類存在するが、半分以上のF-boxタンパク質の標的分子は明らかにされていない。本研究はこれまで未知であったF-boxタンパク質の機能を解明することを目的とする。
常法に則りF-boxタンパク質と結合するものの中から基質のスクリーニングを行うべく、基質と安定に結合できる変異体を作成して研究を進めてきたが、25年度はより積極的に目的とするF-boxタンパク質によりユビキチン化を受けた標的タンパク質を抽出・同定する方法を新たに開発し、その検証を行った。
生体内において、ポリユビキチン化されたタンパク質はプロテアソームにより速やかに分解され、またポリユビキチン鎖は脱ユビキチン化酵素により取り除かれてしまうため、ユビキチン化基質を単離し同定することは困難であった。今回開発したUbiquitin-catcher法は、試験管内でポリユビキチン化タンパク質を濃縮するアフィニティプローブとして報告のあったTUBEを利用した物で、タグ付きトリプシン耐性型のTUBE変異体(Ub-catcher)を培養細胞に発現させる方法である。この方法により阻害剤非存在下でも、ユビキチン化タンパク質を細胞内に安定に蓄積させ、免疫沈降により濃縮することに成功している。また目的とするF-boxタンパク質との共発現によりユビキチン化した標的分子の蓄積量がかなり増加した。免疫沈降物のトリプシン分解物をユビキチンシグニチャーであるdiGlyに対する抗体で二次濃縮したものを質量分析により解析することで、効率よく標的分子の同定を行うことが可能となった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

今年度のスクリーニング法の開発は当初の計画には無かったものはであるが、これまで万能な方法のなかったユビキチン化基質の効率よい同定法の開発に成功したため、今後の研究の発展に生かすことができる。基質がわかっているF-boxタンパク質を用いて既知の基質のみならず、新たな基質の同定も可能である事が分かったので、当初の計画にあるF-boxタンパク質の基質の網羅的解析に道が開けた。

今後の研究の推進方策

新たに開発したユビキチン化基質同定法Ubiquitin-Catcher法を用いて、これまで機能未知であったF-boxタンパク質の基質を網羅的に同定・解析を行っていく。

次年度の研究費の使用計画

今年度はスクリーニング系の確立を行い成功したため、来年度はこれを用いて網羅的解析を行っていく予定である。そのためには多くの抗体が必要であり、今年度予算から次年度へそちらの解析に用いるための物品費へ移行させた。
物品費(抗体などのタンパク質の解析試薬)に充足する予定である。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2013 その他

すべて 学会発表 (2件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [学会発表] ポリユビキチン結合タンパク質を利用したポリユビキチン化基質の効率的同定法の確立.2013

    • 著者名/発表者名
      吉田雪子、佐伯泰、村上有沙、土屋光、田中啓二.
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] FBXO17 is involved in formation of stress granule.2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, Y., Murakami, A., Shindo, M., and Tanaka, K.
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20130911-20130913
  • [備考] 東京都医学総合研究所・蛋白質代謝研究室・吉田チーム

    • URL

      http://www.igakuken.or.jp/pro-meta/studies/yoshida.html

  • [産業財産権] ポリユビキチン化基質の同定方法2013

    • 発明者名
      吉田雪子、佐伯泰、土屋光、村上有沙、田中啓二.
    • 権利者名
      吉田雪子、佐伯泰、土屋光、村上有沙、田中啓二.
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2013-237362
    • 出願年月日
      2013-11-15

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公開日: 2015-05-28  

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