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これまでの２年間の研究で、すべての個体に制限を付加した制限付きBLUP法（AR-BLUP法）と選抜候補個体にのみ制限を付加した制限付きBLUP法（PR-BLUP法）の選抜反応を比較した結果、AR-BLUP法よりもPR-BRUP法のほうが優れていることを明らかにした。そこで、PR-BLUP法に代わる方法として、AR-BLUP法の汎用プログラムの公開に向けて、現在準備を進めているところである。
一方、PR-BLUP法を相対希望改良量達成のための選抜に用いる場合、選抜形質に欠測記録がある個体のデータを利用することができない。そこで、相対希望改良量を達成するための形質の育種価に対する重み付け値を用いて総合育種価を推定する方法について検討した。シミュレーションはブタの系統造成を想定し、種雄豚１頭に５頭の雌豚を交配し，一腹あたり雄１頭，雌２頭を育成するものとした。選抜は２形質を想定し、遺伝率をそれぞれ0.2および0.6とした。遺伝相関は-0.5、0.0、0.5の３通りとした。表型相関は遺伝相関に等しいものとした。選抜形質１と選抜形質２の相対希望改良量はそれぞれの１遺伝標準偏差とした。血縁情報は、選抜候補個体自身とその血縁個体の表型価を用いるものとした。選抜候補個体との血縁係数が1/4以上の個体の情報を用いて家系選抜指数から選抜形質の重み付け値を算出することで、選抜形質の遺伝的改良量が希望改良量の方向に一致することが明らかとなった。なお、この場合の遺伝的改良量は、選抜候補個体のみの情報による選抜指数に比べ24～28％増加することが期待される。しかし、BLUP法選抜による遺伝的改良量は、選抜候補個体のみの情報を用いた場合の期待改良量よりも小さいことから、系統造成における改良目標は家系選抜指数により算出した期待改良量よりも２～３割程度低めに設定する必要があると考えられた。
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