本課題では細胞の性質変換過程における蛋白質の発現変化を捉えることを目的としてきた。そのために質量分析装置(MS)を用いた蛋白質の同定技術の改良を進めた。まず、試料の分離を良くするためにメートル長のモノリスカラムを用い、さらに細胞を膜・細胞質・核に分画しそれぞれの試料を解析することで最終的に同定できる蛋白質数の増加を実現できた。また、サンプル間の比較定量を正確に行うためのラベル化技術を組み合わせることにより、少ない試料を高感度で精度良く定量する技術の確立を行うことができた。この技術を用いてヒトiPS細胞と元の線維芽細胞の解析を行ったところ、これまで同定が難しかった遺伝子の同定が可能となった。
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