| 研究課題/領域番号 |
24590831
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| 研究機関 | 独立行政法人国立がん研究センター |
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研究代表者 |
小川 朝生 独立行政法人国立がん研究センター, 臨床開発センター, 分野長 (10466196)
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| 研究分担者 |
内富 庸介 岡山大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (60243565)
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| キーワード | 疫学 / 分子疫学 / 臨床精神分子遺伝学 / 緩和医療 |
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| 研究概要 |
肺がんの原因究明と新たな支持療法開発のために構築されたデータベースに登録された1800例のデータベースを対象に、下記の遺伝子解析を実施した。
1) 対象患者のメタノール固定パラフィン包埋病理組織標本からlaser capture microdissection (LCM)を用いて、特異的に肺癌細胞を取り出し、ゲノムDNAを抽出する。がん細胞のDNA上の遺伝的多型と体細胞変異を区別するための比較材料として、がん部と同等の品質のDNAを得るために同時に切除された非がん組織からもゲノムDNAを抽出する。
2) 抽出したDNAからSure Select Target Enrichment System (Agilent Technologies社)等を用いて全エクソン領域を濃縮する。この領域をIllumina Genome Analyzer等を用いてpaired-end sequencing法により95%以上の領域で10 depth以上、70%以上の領域で30 dept
h以上のcoverageを目標にシーケンスを行う。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
遺伝子多型の決定が済んだ解析例に対して、追って解析を追加している。別プロトコールの研究と併せて解析を実施しており計画の修正があり進捗がやや遅れている。
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| 今後の研究の推進方策 |
今後シーケンスを継続して行う。これによりゲノムDNAの変異、構造異常等が見出されたものについて、サンガー法によるDNAシーケンス、DNAマイクロアレイ法等を応用し確認を行う。
その後、 対象患者の臨床背景、心理社会的因子（Mental Adjustment to Cancer (MAC) scaleおよびHospital Anxiety and Depression Scale (HADS)）について上記データベースから抽出する予定である。
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| 次年度の研究費の使用計画 |
遺伝子多型の決定が済んだ解析例に対して、追って解析を追加している。別プロトコールの研究と併せて解析を実施しており計画の修正があり進捗がやや遅れているため。
遺伝子多型の決定が済んだ解析例に対して、追って解析を追加している。別プロトコールの研究と併せて解析を実施する。
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