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2013 年度 実施状況報告書

エピジェネティクスに基づく肝癌予後予測のためのハイブリッド型血液テスト

研究課題

研究課題/領域番号 24592002
研究機関山口大学

研究代表者

飯塚 徳男  山口大学, 医学部附属病院, 准教授 (80332807)

キーワード肝癌 / メチル化 / 血清DNA
研究概要

本研究では『肝癌患者の予後を低侵襲かつ正確に予測できる血液テスト開発を行う』を目的とする。プールしたアレイデータおよび新規解析した全ゲノム対応アレイ解析データから、予後不良の肝癌で発現が低下し、且つ、プロモーター領域にCpGアイランドを保有する遺伝子20個を同定した。引き続き20遺伝子の発現解析とメチル化解析を10症例でリアルタイムRT-PCR法およびQSPで検証し、8個まで絞り込みを行った。さらに追加した10症例で、原発巣における発現低下と血清セルフリーDNA中のメチル化状態、そして予後との関連性を確認できた6遺伝子CFTR, RASF1A, SRD5A2, CCND2, SPINT2, BASPで以下の実験を行った。63例の肝癌患者の血清DNAにおける上記6遺伝子のメチル化をPCRで定量化してスコアシステムを構築した。6遺伝子からN個の遺伝子を選び、スコア化を行い、もっとも感度・特異度の高い組み合わせおよびスコア式を決定した(4個の遺伝子で感度56%、特異度68%)。関連する成果報告を海外雑誌および国内での学会にて行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

性能は若干劣るが、当初の目的である『肝癌患者の予後を低侵襲かつ正確に予測できる血液テスト開発を行う』を達成した。現在、テストサンプルでの検証を残すのみである。

今後の研究の推進方策

テストサンプルでの検証を行うとともに、得られたデータを基盤として、さらに性能アップを図るためのシステム作りを行っている。

次年度の研究費の使用計画

血清DNAを用いたメチル化遺伝子の定量解析が順調に進んだことにより、研究コストを低額に抑えられたため、次年度使用額(4336円)が生じた。
次年度の論文発表や学会発表の費用と併せて使用する。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2103 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] ABCB6 mRNA and DNA methylation levels serve as useful biomarkers for prediction of early intrahepatic recurrence of hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma.2103

    • 著者名/発表者名
      Tsunedomi R, Iizuka N. et al
    • 雑誌名

      Int J Oncol

      巻: 42 ページ: 1551-1559

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Susceptibility of hepatoma-derived cells to histone deacetylase inhibitors is associated with ID2 expression.2013

    • 著者名/発表者名
      Tsunedomi R, Iizuka N. et al
    • 雑誌名

      Int J Oncol

      巻: 42 ページ: 1159-1166

    • 査読あり
  • [学会発表] メチル化遺伝子に基づいた切除後肝細胞癌の肝内早期再発予測2013

    • 著者名/発表者名
      兼清信介、飯塚徳男 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      20131003-20131005
  • [学会発表] 血清メチル化遺伝子による肝細胞癌切除後の予後予測2013

    • 著者名/発表者名
      兼清信介、飯塚徳男 他
    • 学会等名
      第113回日本外科学会定期学術集会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      20130411-20130413

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公開日: 2015-05-28  

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