研究課題/領域番号 |
24651221
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研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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配分区分 | 補助金 |
研究分野 |
ゲノム医科学
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研究機関 | 新潟大学 |
研究代表者 |
長谷川 舞衣 新潟大学, 脳研究所, 研究員 (50596153)
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連携研究者 |
桑野 良三 新潟大学, 脳研究所, 教授 (20111734)
中谷 明弘 新潟大学, 超域学術院, 准教授 (60301149)
宮下 哲典 新潟大学, 脳研究所, 助教 (60323995)
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研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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キーワード | 核内高次構造 / クロマチン構造 / 発現制御 / ポストGWAS |
研究概要 |
ゲノムワイド関連解析(GWAS)で見いだされる疾患感受性の一塩基多型(SNP)のうち、非コード領域に位置するものについては、疾患への関与機序が不明なものが多い。本研究では、これらのSNP 周辺の配列が、ゲノム配列上離れて位置する遺伝子の調節配列である可能性に着目し、ポストGWAS解析に特化した核内ゲノムDNA の高次構造解析法の開発を行った。ゲノムワイドな高次構造解析法であるtethered conformation capture (TCC)とビオチン化RNA プローブを用いた疾患感受性SNP 周辺配列のプルダウンを併用することで、空間的に近接する部位の効率的な検出が可能であることを示した。
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