東アジアの鳥類の種多様性起源地としての日本列島

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24657066
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 独立行政法人国立科学博物館
• 研究代表者: 西海 功 独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, 研究主幹 (90290866)
• 連携研究者: 森 さやか 独立行政法人国立科学博物館, 分子生物多様性研究資料センター, 特定非常勤研究員 (70623867)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: 種の起源 / 種分化 / DNAバーコード / 分散 / 系統地理 / 日本列島 / 鳥類 / ユーラシア

研究概要

日本列島が豊富なアジアの鳥類種の供給地となってきた可能性について、主にmtDNAバーコード領域の分子系統樹によって検討をおこなった。まず、184種831個体の日本繁殖種のバーコード配列を読み、BOLDデータベースのプロジェクトBJNSMに登録した。11の鳥類プロジェクトの234種1,367個体の日本繁殖種を含む699種4,636個体のデータを統合して、NJ法による系統樹を作成したところ、合計30種の鳥類で、日本列島の集団が最も遺伝的多様性が高く、かつ、系統樹の基部に位置することがわかった。これは少なからぬ鳥類種が日本列島起源であることを示唆する。生物系統地理学的な正確な分析が今後望まれる。

研究成果

• [雑誌論文] DNA barcoding reveals 24 distinct lineages as cryptic bird species candidates in and around the Japanese Archipelago (2014)
  • 著者名/発表者名: Saitoh T, Sugita N, Someya S, Iwami Y,Kobayashi S, Kamigaichi H, Higuchi A,Asai S, Yamamoto Y & Nishiumi I
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 巻: Vol. 14
  • DOI: 10.1111/1755-0998.12282/abstract
  • 査読あり
• [雑誌論文] Incorporating color into integrative taxonomy : Analysis of the varied tit (Sittiparus varius) complex in East Asia (2014)
  • 著者名/発表者名: McKay, B.D., H. L. Mays Jr, C.-T. Yao,D Wan, H. Higuchi and I. Nishiumi
  • 雑誌名: Systematic biology 巻: Vol. 63
  • DOI: 10.1093/sysbio/syu016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tandem duplications in the c-terminal domain of the mesotocin receptor exclusively identified among East Eurasian thrushes (2013)
  • 著者名/発表者名: Abe, H., I. Nishiumi and M. Inoue-Murayama
  • 雑誌名: Journal of molecular evolution 巻: 77 ページ: 260-267
  • 査読あり
• [雑誌論文] An empirical comparison of character-based and coalescent-based approaches to species delimitation in a young avian complex (2013)
  • 著者名/発表者名: McKay, B., H. L. Mays Jr, Y. Wu, H. Li,C.-T. Yao, I. Nishiumi and F. Zou
  • 雑誌名: Molecular Ecology 巻: 22 ページ: 4943-4957
  • 査読あり
• [雑誌論文] Geographical variation in mitochondrial DNA and vocalizations in two resident bird species in the Ryukyu Archipelago, Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Hamao, S., N. Sugita and I. Nishiumi
  • 雑誌名: Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series A 巻: 39(1) ページ: 51-62
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of two distinctive mitochondrial DNA lineages of the Japanese Robin Lucinia akahige across its breeding range around the Japanese islands (2013)
  • 著者名/発表者名: Seki, S.-I., I. Nishiumi and T. Saitoh
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 29 ページ: 681-689
  • 査読あり
• [雑誌論文] 豊岡の飼育下および野外のコウノトリの遺伝的多様性と繁殖計画への示唆 (2012)
  • 著者名/発表者名: 内藤和明・西海 功・大迫義人
  • 雑誌名: 野生復帰 巻: 2 ページ: 57-62
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA バーコーディングと日本の鳥の種分類 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 雑誌名: 日本鳥学会誌 巻: 61 ページ: 223-237
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分類学・系統地理学研究の歩みと成果 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 雑誌名: 日本鳥学会誌 巻: 61(特別) ページ: 35-38
• [雑誌論文] メボソムシクイPhylloscopus borealis(Blasius)の分類の再検討 : 3つの独立種を含むメボソムシクイ上種について (2012)
  • 著者名/発表者名: 齋藤武馬・西海 功・茂田良光・上田恵介
  • 雑誌名: 日本鳥学会誌 巻: 61 ページ: 46-59
  • 査読あり
• [学会発表] Japanese Islands may have contributed to the rich species diversity of East Asian birds : results of DNA barcoding (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishiumi, I. and C-H. Kim
  • 学会等名: 26th International Ornithological Congress
  • 発表場所: Rikkyo University, Tokyo
  • 年月日: 20140818-24
• [学会発表] Integrative taxonomy and biogeographic history of the Varied Tit (Sittiparus varius) (2013)
  • 著者名/発表者名: McKay, B. D., H. L. Mays, C. Yao, D.Wan, and I. Nishiumi
  • 学会等名: The 131st Stated Meetings of the American Ornithologists' Union
  • 発表場所: The Field Museum, Chicago
  • 年月日: 20130813-17
• [学会発表] ヤマガラの系統地理と鬱陵島の亜種シマヤマガラの独立性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 杉田典正・金昌會・藤田薫・樋口広芳・西海功
  • 学会等名: 日本鳥学会2013年度大会
  • 発表場所: 名城大学
  • 年月日: 2013-09-14
• [学会発表] 北海道のカササギ侵入個体群と大陸個体群の遺伝的構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 森さやか・長谷川理・江口和洋・早矢仕有子・藤岡正博・Alexey Kryukov・西海功
  • 学会等名: 日本鳥学会2013年度大会
  • 発表場所: 名城大学
  • 年月日: 2013-09-14
• [学会発表] クロツラヘラサギPlatalea minor の近縁種におけるコントロール領域の重複構造の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 曺炯柱・西海功・荒谷邦雄
  • 学会等名: 日本鳥学会2013年度大会
  • 発表場所: 名城大学
  • 年月日: 2013-09-14
• [学会発表] 南西諸島における留鳥性鳥類4 種の遺伝的変異とさえずりの変異 (2013)
  • 著者名/発表者名: 濱尾章二・杉田典正・西海功
  • 学会等名: 日本鳥学会2013年度大会
  • 発表場所: 名城大学
  • 年月日: 2013-09-14
• [学会発表] 南西諸島の小鳥たちの地域変異―南へ行くほど黒くなる種、小さくなる種 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 学会等名: 平成25年度自然史学会連合講演会「みる!きく!さわる!博物館～五感で感じる生物多様性～」
  • 発表場所: 沖縄県立博物館
  • 年月日: 2013-07-28
• [学会発表] マイクロサテライトマーカーを用いた九州カササギ個体群の遺伝的構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 森さやか・江口和洋・長谷川理・西海功
  • 学会等名: 第60回日本生態学会大会
  • 発表場所: 静岡県コンベンションアーツセンター
  • 年月日: 2013-03-08
• [学会発表] マイクロサテライトDNA解析により解明された日本のライチョウの遺伝的分化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功・四方田紀恵・笠原里恵・中村浩志
  • 学会等名: 第13回ライチョウ会議岐阜大会
  • 発表場所: 高山市民ホール
  • 年月日: 2012-10-14
• [学会発表] DNA barcoding and the perspective of researches on species classification in Asia : Japanese Islands may have contributed to the rich species diversity in Asian birds (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishiumi, I.
  • 学会等名: Centennial Commemoration Symposium,Ornithological Society of Japan
  • 発表場所: University of Tokyo
  • 年月日: 2012-09-16
• [学会発表] Microsatellite DNA analysis divided Japanese Rock Ptarmigan into four genetic clusters (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishiumi, I., N. Yomoda, S. Kasahara and H. Nakamura
  • 学会等名: The 12th International Grouse Symposium
  • 発表場所: Matsumoto
  • 年月日: 2012-07-22
• [図書] 鳥類分類表. 岩波生物学辞典 第5版 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 総ページ数: 2192
  • 出版者: 岩波書店
• [図書] 行動生物学辞典(上田恵介他編) (2013)
  • 著者名/発表者名: 西海 功(分担執筆)
  • 総ページ数: 637
  • 出版者: 東京化学同人
• [図書] 分子が明かす鳥の世界 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 総ページ数: 2013(1-12): 22-23
  • 出版者: グリーン・パワー
• [図書] 企画展:鳥類の多様性―日本の鳥類研究の歴史と成果 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 総ページ数: (643): 40-42
  • 出版者: うえの
• [図書] 日本鳥学会100 周年記念展示「鳥類の多様性―日本の鳥類研究の歴史と成果」企画概要 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 総ページ数: 36-37
  • 出版者: 日本鳥学会100周年記念行事2012
• [図書] 日本鳥類目録改訂第7版 (2012)
  • 著者名/発表者名: 柳澤紀夫・平岡 考・西海 功・齋藤武馬・綿貫 豊・山崎剛史・池長裕史・川上和人(編)
  • 総ページ数: 438
  • 出版者: 日本鳥学会
• [図書] 鳥類の分類―DNA による新知見と分類の行方.野鳥,7: (2012)
  • 著者名/発表者名: 西海 功
  • 総ページ数: 4-14
• [備考] BOLD systems 内Public Data Portal
  • URL: http://www.boldsystems.org
• [備考] プロジェクト名:BJNSM: Birds of Japan,NSMT