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2013 年度 実績報告書

高分子量蛋白質の新規NMR構造解析法の開発とフロリゲン受容体への応用

研究課題

研究課題/領域番号 24657074
研究機関大阪大学

研究代表者

児嶋 長次郎  大阪大学, たんぱく質研究所, 准教授 (50333563)

キーワードNMR / 構造生物学 / フロリゲン
研究概要

平成25年度は平成24年度に引続き技術開発とフロリゲン受容体の構造解析に関する、(1)高感度13C直接観測法の開発、(2)13C帰属法、13Cの核間距離情報取得法、構造計算法の開発、(3)フロリゲン受容体の構造解析を進め、(4)抑制型フロリゲン受容体複合体の立体構造解析を可能にする手法の開発に取り組んだ。
(4)抑制型フロリゲン受容体複合体の立体構造解析のための手法開発:分子量10万の抑制型フロリゲン受容体複合体の構造決定は機能解析に必須である。そこで、まず抑制型フロリゲン受容体複合体の構成因子(抑制型フロリゲン、受容体、転写因子)のNMR測定を行い、抑制型フロリゲンと転写因子で良好な 1H-15N HSQC スペクトルが得られた。これらについては、溶液NMRの常法によって構造解析に取り組んだ。受容体については重水素化することで、良好な1H-15N TROSY HSQC スペクトルが得られたため、TROSY 法をベースとした帰属のための三重共鳴実験を行った。また、構成因子を個別に安定同位体標識し、複合体形成による立体構造変化とNMR滴定実験による結合部位の決定を進めた。その結果、受容体における活性型フロリゲンと抑制型フロリゲンの結合部位が同じであること、結合が競合することなどが明らかとなった。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of a rice Rac/Rop GTPase, OsRac12014

    • 著者名/発表者名
      Kosami K
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F70 ページ: 113-115

    • DOI

      10.1107/S2053230X13033645

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure of metallo-DNA with consecutive T-HgII-T base-pairs explains positive entropy for the metallo-base-pair formation2014

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 42 ページ: 4094-4099

    • DOI

      10.1093/nar/gkt1344

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 1H, 15N and 13C resonance assignments of the conserved region in the middle domain of S. pombe Sin1 protein2014

    • 著者名/発表者名
      Kataoka S
    • 雑誌名

      Biomol NMR Assign

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and function of florigen and the receptor complex2013

    • 著者名/発表者名
      Ken-ichiro Taoka, Izuru Ohki, Hiroyuki Tsuji, Chojiro Kojima and Ko Shimamoto
    • 雑誌名

      Trends Plant Sci.

      巻: 18 ページ: 287-294

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Formation of the T-HgII-T Metal-Mediated DNA Base Pair; Proposal and Theoretical Calculation of the Reaction Pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Sebera
    • 雑誌名

      Chemistry

      巻: 19 ページ: 9884-9894

    • DOI

      10.1002/chem.201300460

    • 査読あり
  • [学会発表] Sensitivity-enhanced protein NMR techniques developed for ultra-high field NMR2013

    • 著者名/発表者名
      Kojima C
    • 学会等名
      The 4th Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      Seoul National University(韓国)
    • 年月日
      20130705-20130705
    • 招待講演

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公開日: 2015-05-28  

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