選択的オートファジーの積荷を予測するアルゴリズムの作製とスクリーニングへの応用

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24657083
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 機能生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鈴木 邦律 東京大学, 新領域創成科学研究科, 准教授 (20373194)
• 連携研究者: 野田 展生 微生物化学研究所, 主席研究員 (40396297)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: 細胞内タンパク質分解 / オートファジー / 選択的オートファジー / オートファゴソーム / 出芽酵母

研究概要

本研究では、タンパク質分解に関わるオートファゴソーム（以下AP）というオルガネラを単離し、内容物を網羅的に同定した後、統計処理を行うことで、AP内に選択的に積み込まれるタンパク質を網羅的に同定しようとしたものである。本研究結果により、非選択的と考えられてきたオートファジーの積荷タンパク質の多くに偏りのあることが明らかとなった。今後はこの偏りを生み出す分子機構を明らかにし、真核生物における選択的オートファジーの生理的役割を解明したい。

研究成果

• [雑誌論文] Proteomic profiling of autophagosome cargo in Saccharomyces cerevisiae (2014)
  • 著者名/発表者名: Kuninori Suzuki, Shingo Nakamura, Mayumi Morimoto, Kiyonaga Fujii, Nobuo N. Noda, Fuyuhiko Inagaki, Yoshinori Ohsumi
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 ページ: e91651
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0091651
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fine mapping of autophagy-related proteins during autophagosome formation in Saccharomyces cerevisiae (2013)
  • 著者名/発表者名: Kuninori Suzuki, Manami Akioka, Chika Kondo-Kakuta, Hayashi Yamamoto and Yoshinori Ohsumi
  • 雑誌名: J. Cell Sci. 巻: 126 ページ: 2534-2544
  • DOI: 10.1242/jcs.122960
  • 査読あり
• [雑誌論文] Organelle acidification is important for localisation of vacuolar proteins in Saccharomyces cerevisiae (2013)
  • 著者名/発表者名: Risa Matsumoto, Kuninori Suzuki and Yoshikazu Ohya
  • 雑誌名: Protoplasma 巻: 250 ページ: 1283-1293
  • DOI: 10.1007/s00709-013-0510-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective autophagy in budding yeast (2013)
  • 著者名/発表者名: Kuninori Suzuki
  • 雑誌名: Cell Death Differ 巻: 20 ページ: 43-48
  • DOI: 10.1038/cdd.2012.73
  • 査読あり
• [雑誌論文] Autophagosome formation can be achieved in the absence of Atg18 by expressing engineered PAS-targeted Atg2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Takafumi Kobayashi, Kuninori Suzuki and Yoshinori Ohsumi
  • 雑誌名: FEBS Lett 巻: 586 ページ: 2473-2478
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2012.06.008
  • 査読あり
• [学会発表] オートファジーによる被分解タンパク質の網羅的解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 鈴木邦律
  • 学会等名: 第65回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: ウインクあいち(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 20130619-21
• [学会発表] Fine mapping of現在これらのタンパク質がAPに選択的に取autophagy-related proteins during autophagosome formation in Saccharomyces cerevisiae (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木邦律
  • 学会等名: 第64回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 20120528-31
• [備考]
  • URL: http://ps.k.u-tokyo.ac.jp/