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2012 年度 実施状況報告書

コアプロモーター認識因子の選択によるmRNA運命決定機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24657119
研究種目

挑戦的萌芽研究

研究機関横浜市立大学

研究代表者

古久保 哲朗  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (10271587)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード転写調節 / 転写因子 / TFIID / SAGA / TBP / 局所翻訳制御 / 出芽酵母 / TAF
研究概要

基本転写因子TFIIDはTATAボックス結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴タンパク質(TAF)から構成される巨大なタンパク質複合体であり、その類縁複合体であるSAGA(16種類のサブユニットのうち、5種類のTAFをTFIIDと共有する)とともにコアプロモーター上で働き、TBP-DNA相互作用を制御することによって転写の活性化を行う。最近我々は、同一のプロモーターからTFIIDまたはSAGAによって転写されるCLN2 mRNA(以下CLN2 mRNA[TFIID], CLN2 mRNA[SAGA])が、同一の一次構造を有するにもかかわらず、機能の異なる二種類のCln2pに翻訳される可能性を示した。またCLN2 mRNA[SAGA]は、RNA結合タンパク質の一種であるSsd1p依存的に転写され、分解から保護されるとともに、RAMシグナル経路による局所翻訳制御を受けることを示唆する結果を得た。
今回我々は、(i)TFIID内部のTBP制御領域であるTAND (Taf1p N-terminal domain)の欠失変異体(taf1-deltaTAND)株において、Ssd1p依存的に分解から保護されるCLN2 mRNA[SAGA]量が有意に増加すること、(ii)RAMシグナル経路の各種変異はtaf1-deltaTAND変異に対して特異的な合成致死性を示すこと、(iii)当該合成致死性はSsd1pとは異なる他のRNA結合タンパク質の変異により抑圧されること等を明らかにした。以上の結果は、TANDがCLN2 mRNAの作り分け([TFIID] or [SAGA])に関与すること、ならびにCLN2 mRNA[SAGA]は複数のRNA結合タンパク質によって制御されていることを示しており、大変興味深い。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

TFIID内部のTBP制御領域であるTANDがCLN2 mRNAの作り分け([TFIID] or [SAGA])に関与する可能性、ならびにCLN2 mRNA[SAGA]が複数のRNA結合タンパク質によって制御されている可能性が新たに示唆されたため。

今後の研究の推進方策

Ssd1pと今回新たに同定したもう一つのRNA結合タンパク質について、各々直接CLN2 mRNAに結合するか否かを調べる。また直接結合する場合には、CLN2 mRNA上に存在すると考えられる認識配列の決定を行う。さらにm-TAG法を用いてCLN2 mRNA[TFIID]及びCLN2 mRNA[SAGA]の細胞内局在を調べ、Cln2pが有する二種類の機能との連関について新たな知見を得る。

次年度の研究費の使用計画

残額197,618円を物品費(細胞内局在観察用試薬購入費)として使用する予定である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Transcription in Eukaryote (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press ページ: in press

  • [雑誌論文] Transcription Initiation in Eukaryote (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press ページ: in press

  • [雑誌論文] Mechanisms of Transcriptional Activation and Repression (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press ページ: in press

  • [雑誌論文] Identification and recombinant analysis of botrocetin-2, a snake venom cofactor for von Willebrand factor-induced platelet agglutination2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamamoto-Suzuki
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 ページ: 5329-5338

    • DOI

      10.1021/bi300442c

    • 査読あり
  • [学会発表] 母性mRNAの3’非翻訳領域を標的としたアンチセンスモルフォリノオリゴによるpoly(A)鎖短小化機構の解析

    • 著者名/発表者名
      茂呂華奈子
    • 学会等名
      日本分子生物学会第35回年会
    • 発表場所
      福岡

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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