| 研究課題/領域番号 |
24658078
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| 研究機関 | 徳島大学 |
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研究代表者 |
櫻谷 英治 徳島大学, ソシオテクノサイエンス研究部, 教授 (10362427)
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| 研究分担者 |
安藤 晃規 京都大学, 学際融合教育研究推進センター生理化学研究ユニット, 助教 (10537765) [辞退]
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| キーワード | Prototheca / alkane degradation / subterminal oxidation / secondary alcohol |
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| 研究実績の概要 |
微細藻Prototheca zopfii JCM9400のドラフトゲノム解析を評価することを試みた。GC含量は極めて高く、ORFで約60%、非翻訳領域では70%以上示した。GC含量が極めて高いためにゲノム情報のコンティグ数が多くなり遺伝子のアノテーションを行うことが難しかった。これまでに解析を行ったsecondary alcohol dehydrogenase (SADH)のホモログ遺伝子の探索を試みたが、遺伝子の断片化のため同定することはできなかった。また、これまでにバクテリアなどで報告されているバイヤビリガーモノオキシゲナーゼと類似の配列を見い出すことができなかった。
P. zopfiiは我々がこれまでに得た微生物の中で最も効率的にアルカンをサブターミナル酸化経路で代謝することができる。アルカンの分解能力の高さだけでなく、細胞表層の高い新油性も影響していると考えられる。そこで、遺伝子工学的アプローチでこれらメカニズムを解明するために、P. zopfiiの形質転換系の構築を試みた。まずは、選択マーカーの探索のために、これまで実績のある薬剤耐性能を試験した結果、カナマイシン、テトラサイクリン、ゼオシンなどの薬剤が比較的低濃度で有効であることがわかった。ここではゼオシン耐性マーカーを利用し、パーティクルガン法による形質転換を試みた。その結果、得られた形質転換体のゲノム上に導入したベクター遺伝子がPCRにより確認することができた。
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