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2012 年度 実施状況報告書

多糖合成酵素に関する新しい分子反応機構の構築と応用研究

研究課題

研究課題/領域番号 24658089
研究機関北海道大学

研究代表者

木村 淳夫  北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (90186312)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
キーワード多糖 / ドメイン / 合成
研究概要

多糖の合成酵素が示す反応を「転移作用(初発反応)と伸長作用」に分け、1)分子解析を行い、かつ、2)合成される多糖の構造をコントロールすることが目的である。合成酵素を研究する世界中の科学者は、触媒反応に「伸長」を加える理論を持っていない現状がある。 我々は、オリゴ糖から多糖を合成する酵素(DDaseと略)のドメイン削除体を構築した。削除体はnative酵素と同一の転移能を示したが、伸長反応が大巾に低下した。さらに中型のオリゴ糖を合成する新規酵素(MSaseと略)のアミノ酸置換体に長鎖生成物を産する現象を見出した。この2つの事例は、合成反応を転移と伸長に区別でき、別個の構造因子により両作用の制御が可能であることを示唆する。DDaseとMSaseを実験対象に、反応の分子機構究明と分子サイズ(物性)の異なる多糖の構築・提供を行う。
(1)X線結晶構造解析:DDaseとMSaseの遺伝子を大腸菌で発現させ、組換え酵素を大量に精製した。また、DDaseに関してはドメイン削除体も大量に調製した。得られた酵素の結晶化条件を調べ、X線構造解析用の単結晶を調製中である。当該実験は次年度も続行させる。
(2)ドメイン削除体:N末端やC末端からのアミノ酸配列の削除体を作製し、多糖合成を評価した。DDaseはC末端を削除しても活性に影響がないが、N末端削除で大きく活性が失われた。MSaseは活性部位の近傍に伸長作用を制御する部位があると考えられた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

初年度ではあるが、酵素の結晶化作業が順調に進められ、かつDDaseとMSaseにおけるドメインの機能を明らかにできたため。

今後の研究の推進方策

研究計画に変更はない。すなわち、触媒ドメインと伸長ドメインに関しさらなる解析を行う。

次年度の研究費の使用計画

主に消耗品費に当てたい。次年度は最終年度であり成果報告にも活用する。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 glycoside hydrolase family 66 homolog catalyzes dextranolytic and cyclization reactions.2012

    • 著者名/発表者名
      Kim YM
    • 雑誌名

      FEBS J.

      巻: 279 ページ: 3185-3191

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1742-4658.2012.08698.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Amino acids in conserved region II are crucial for substrate specificity, reaction velocity, and regioselectivity in transglucosylation of honeybee GH-13 α-glucosidases.2012

    • 著者名/発表者名
      Ngiwsara L
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem

      巻: 76 ページ: 1967-1974

    • DOI

      doi.org/10.1271/bbb.120473

    • 査読あり
  • [学会発表] デキストラン合成酵素dextran dextrinaseの触媒残基およびその機能の決定2013

    • 著者名/発表者名
      貞廣 樹里
    • 学会等名
      日本農芸化学会年次大会
    • 発表場所
      東北大学(仙台)
    • 年月日
      20130324-20130327
  • [学会発表] Domain organization and catalytic amino acids of dextran dextranase: structural similarity to inverting glucoamylase in catalytic domain2012

    • 著者名/発表者名
      Sadahiro J
    • 学会等名
      26th Internal Carbohydrate Symposium
    • 発表場所
      Madrid City Centre (Madrid, Spain)
    • 年月日
      20120722-20120727
  • [学会発表] Structural insights into specificity for long-chain substrates of sugar beet α-glucosidase.2012

    • 著者名/発表者名
      Tagami T
    • 学会等名
      Plant and Seaweed Polysaccharides Workshop
    • 発表場所
      Nantes Event Center (Nantes, France)
    • 年月日
      20120717-20120720

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公開日: 2014-07-24  

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