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2012 年度 実施状況報告書

循環器コホート分析における血縁構造化の影響の調査

研究課題

研究課題/領域番号 24659316
研究機関山形大学

研究代表者

柴田 恭子  山形大学, 医学部, 助教 (90535600)

研究分担者 田宮 元  山形大学, 医学部, 教授 (10317745)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2013-03-31
キーワード疫学研究 / 交絡因子 / 血縁構造
研究概要

遺伝学研究で用いられている大規模ゲノムデータ用血縁構造計測法を用いて、山形県高畠町で収集したサンプル集団約1,600人に関する60万のゲノムワイドSNPジェノタイプデータを解析した結果、20.2%の血縁構造を検出した。
その血縁構造化の影響を調べるために、血縁構造を除外した集団と、除外しない集団で、表現型(血圧)とリスク環境要因(飲酒暦、喫煙暦、BMI)の関連性に交絡因子として血縁構造化の影響はあるか詳細な重回帰分析を行った。
その結果、サンプルサイズ約1,000人、血縁構造の程度20.2%、集団の有病率25%、血縁者集団内の有病率26%、遺伝率14.3%、血縁構造を除外した集団内の有病率26%のケースで、両集団間で推定された回帰係数に違いはないことが示された(P-value=0.55)。一方で、遺伝率20%より大きい場合、交絡因子として血縁構造の影響は小さくないことを示した。
本研究によって、①対象とする全集団内の表現型(血圧)の有病率(25%, 40%, 50%)、②サンプルサイズ(1,000, 400, 500)、③血縁構造化の程度(20%, 40%, 50%)、④遺伝率(14%, 22%, 32%)、⑤血縁者集団内の有病率(26% fixed)、の観点で、血圧とリスク環境因子の関連性に交絡因子として血縁構造化の影響がどの程度あるか明らかにすることができた。これらのパラメータの大きさによっては、これまで環境因子を中心とした疫学研究で得られてきた結果を再検証する必要があることが示された。今後、表現型(血圧)と環境因子との関連解析を行う際は、上記5つの観点にもとづき、はじめに集団の血縁構造を計測し、近い血縁者を除外した対象集団で、表現型と環境因子との関連解析を行う必要がある。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究の成果発表を平成24年11月に米国人類遺伝学会で行った。
本研究論文が、平成25年2月にMolecular Genetics&Genomic Medicine誌に受理された。現在、出版のための事務手続き中である。

今後の研究の推進方策

本研究が、平成25年2月にMolecular Genetics&Genomic Medicine誌に受理されたため、その出版のための事務手続きを進めていく予定である。

次年度の研究費の使用計画

本研究の出版手続きをすすめていく際、論文掲載に係る経費、および論文別刷り料として、約2000ドルが必要である。昨年度の残額は、そのための費用として使用する予定である。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] The confounding effect of cryptic relatedness for environmental risks of systolic blood pressure on cohort studies.2013

    • 著者名/発表者名
      柴田恭子、寶澤篤、田宮元、植木優、中村智洋、成松宏人、久保田功、上野義之、加藤丈夫、山下英俊、深尾彰、嘉山孝正、山形大学ゲノムコホートコンソーシアム
    • 雑誌名

      Molecular Genetics&Genomic Medicine

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      10.1002/mgg3.4

    • 査読あり
  • [学会発表] The confounding effect of cryptic relatedness for environmental risks of systolic blood pressure on cohort studies2012

    • 著者名/発表者名
      柴田恭子、寶澤篤、田宮元、植木優、中村智洋、成松宏人、久保田功、上野義之、加藤丈夫、山下英俊、深尾彰、嘉山孝正、山形大学ゲノムコホートコンソーシアム
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      米国サンフランシスコ MOSCONE CTR NORTH
    • 年月日
      20121110-20121116

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公開日: 2014-07-24  

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