ヌクレオチド除去修復欠損性日光過敏症のウイルス発現系とゲノム解析による網羅的探索

2014 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 24659533
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 荻 朋男 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 准教授 (80508317)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: ヌクレオチド除去修復

研究実績の概要

本研究では、以下の3つの課題に取り組んだ。
課題1: 国内外の「ヌクレオチド除去修復(NER)欠損性日光過敏症」患者由来の初代培養細胞等を継続的に収集し、長崎大学においてセルバンク化する。課題2: 既知のNER遺伝子を組み込んだレンチウイルスライブラリーを作製する。これらをNER欠損性疾患細胞に感染させ、修復活性測定による相補性試験を実施することで、既知のNER遺伝子が疾患責任遺伝子であるかを迅速に判定する臨床診断システムを構築する。課題3: 既知のNER遺伝子が疾患責任遺伝子ではないと考えられるケースについて、ゲノム解析を実施することにより、新規NER関連遺伝子を探索する。

最終年度には以下を実施した。
課題1: これまでの共同研究先である宇谷厚志教授/長崎大学、錦織千佳子教授/神戸大学、Alan Lehmann教授/英国Sussex大学、Miria Stefanini教授/イタリアCNR、森脇真一教授/大阪医科大学、久保田雅也医長/国立成育医療研究センターの他、立石智/熊本大学、Dr. Hiva Fassihi/ St. John‘s Hospital等から、色素性乾皮症/コケイン症候群/紫外線高感受性症候群等のDNA修復欠損性光線過敏症例の提供を受けるようになり、検体収集ネットワークは順調に拡大した。課題2: 既知のNER遺伝子を組み込んだレンチウイルスライブラリーの作製を実施し、既知のNER遺伝子が疾患責任遺伝子であるかを迅速に判定する臨床診断システムの確立に成功し、多くの依頼を受けるようになった。課題3: 既知のNER遺伝子が疾患責任遺伝子ではないと考えられる検体を複数同定し、次世代ゲノム解析を実施した。

研究成果

• [雑誌論文] A rapid comprehensive assay system for DNA repair activity and cytotoxic effects of DNA damaging reagents by measuring unscheduled DNA synthesis and recovery of RNA synthesis after DNA damage. (2015)
  • 著者名/発表者名: Jia N, Nakazawa Y, Guo C, Shimada M, Sethi M, Takahashi Y, Ueda H, Nagayama Y, Ogi T.
  • 雑誌名: Nature Protocols 巻: 10 ページ: 12-24
  • DOI: 10.1038/nprot.2014.194.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hypomorphic PCNA mutation underlies a human DNA repair disorder. (2014)
  • 著者名/発表者名: Baple EL, Chambers H, Cross HE, Fawcett H, Nakazawa Y, Chioza BA, Harlalka GV, Mansour S, Sreekantan-Nair A, Patton MA, Muggenthaler M, Rich P, Wagner K, Coblentz R, Stein CK, Last JI, Taylor AM, Jackson AP, Ogi T, Lehmann AR, Green CM, Crosby AH.
  • 雑誌名: Journal of Clinical Investigation 巻: 124 ページ: 3137-3146
  • DOI: 10.1172/JCI74593.
  • 査読あり
• [学会発表] 放射線感受性および各種発達異常を示す遺伝性疾患の新規責任遺伝子の同定と分子機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中沢由華、郭朝万、嶋田繭子、宮崎仁美、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Molecular and functional study on the initiation of transcription coupled nucleo tide excision repair (2014)
  • 著者名/発表者名: Guo C, Nakazawa Y, Shimada M, Jia N, Karata K, Miyazaki H, Ogi T.
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 転写と共役したヌクレオチド除去修復のin vitro反応系の構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 唐田清伸、郭朝万、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] コケイン症候群様の臨床症状を示す遺伝性疾患の責任遺伝子探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎仁美、中沢由華、郭朝万、嶋田繭子、賈楠、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] エキソーム解析を用いたDNA修復機構欠損性疾患の新規責任遺伝子の探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 嶋田繭子、中沢由華、郭朝万、賈楠、宮崎仁美、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Molecular cloning and characterisation of new human DNA repair genes (2014)
  • 著者名/発表者名: Ogi T
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] Molecular characterization and functional analysis of XRCC4, a novel pathological gene for radiation sensitivity and developmental abnormalities (2014)
  • 著者名/発表者名: Guo C, Nakazawa Y, Shimada M, Woodbine L, Jia N, Karata K, Miyazaki H, Lehmann A, Jeggo PA, Ogi T.
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] ERCC1/XPF deficiency causes three NER- deficient disorders: a patient with various symptoms of xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome & Fanconi anemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakazawa Y, Kashiyama K, Pilz DT, Guo C, Shimada M, Sasaki K, Fawcett H, Wing JF, Lewin SO, Carr L, Li TS, Yoshiura K, Utani A, Hirano A, Greenblatt D, Nardo T, Stefanini M, McGibbon D, Sarkany R, Fassihi H, Mitsutake N, Lehmann AR, Ogi T.
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] ゲノム不安定性疾患群の新規責任遺伝子の同定と分子機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第57回日本甲状腺学会学術集会
  • 発表場所: コングレコンベンションセンター（大阪府大阪市）
  • 年月日: 2014-11-14
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3K9メチル化酵素類のDNA二重鎖切断修復反応への関与 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会 シンポジウム
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] 転写共役ヌクレオチド除去修復の開始反応の分子機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 日本放射線影響学会第57回大会 ワークショップ
  • 発表場所: 鹿児島県民交流センター（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2014-10-01 – 2014-10-03
• [学会発表] DNA修復機構の異常により発症する先天性疾患とゲノム不安定性/発がん (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第20回日本家族性腫瘍学会学術集会 教育講演
  • 発表場所: コラッセ福島（福島県福島市）
  • 年月日: 2014-06-13
  • 招待講演
• [備考] 長崎大学 がん・ゲノム不安定性研究拠点ホームページ
  • URL: http://www.nrgic.prj.nagasaki-u.ac.jp/