修飾・編集ＲＮＡの構造予測手法の研究開発

2015 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24680031
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 早稲田大学 (2014-2015); 東京大学 (2012-2013)
• 研究代表者: 浜田 道昭 早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00596538)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: RNA / ２次構造予測 / 修飾塩基 / 学習モデル / 確率モデル / 半教師有り学習

研究成果の概要

修飾／編集塩基を含むRNAの構造予測に向けた情報技術の研究開発を行った．修飾／編集塩基を含む既知のRNAの構造データは極めて限られているため，このような限られたデータを用いて，効果的に構造予測を行う手法の開発を行う．具体的には，少数の２次構造データから２次構造の確率モデルを学習するための，半教師有り学習の方法を新しく開発を行った．また，RNAの統合WebサーバRtoolsを開発し，一般に公開した．

自由記述の分野

バイオインフォマティクス