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2013 年度 研究成果報告書

多種薬剤応答パネルデータからの知識抽出法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号 24700292
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生体生命情報学
研究機関東京大学

研究代表者

山口 類  東京大学, 医科学研究所, 講師 (90380675)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
キーワードバイオインフォマティクス / 統計的時系列モデル / 薬剤応答 / 薬剤構造 / 時系列遺伝子発現データ
研究概要

本研究では、多種薬剤刺激応答パネルデータからの知識抽出のための統計的データ解析手法の開発を行った。薬剤構造と薬剤刺激に対する生体の応答プロファイルの異種情報統合の検討を進め、薬剤刺激下の遺伝子発現時系列データから薬剤応答の特徴量抽出法を開発し、その特徴量を利用した薬剤構造から薬剤効果プロファイルを予測するための統計的時系列モデルに基づく手法を開発した。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      Ogami K, Yamaguchi R, Imoto S, Tamada Y, Araki H, Print C, Miyano S.
    • 雑誌名

      BMC Systems Biology

    • 査読あり
  • [学会発表] Modeling of dynamic drug effect on gene networks2013

    • 著者名/発表者名
      Maruyama Y, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S.
    • 学会等名
      The 13^<th> Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2013-08-01
  • [学会発表] Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      尾上健太郎、山口類、井元清也、玉田嘉紀、荒木啓充、Cristin Pring、宮野悟
    • 学会等名
      The 23^<rd> International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      台湾
    • 年月日
      2012-12-12

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公開日: 2015-06-25  

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