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2014 年度 実施状況報告書

高速シーケンサーを用いた遺伝子制御ネットワーク解析技術の開発

研究課題

研究課題/領域番号 24700294
研究機関大阪大学

研究代表者

瀬尾 茂人  大阪大学, 情報科学研究科, 助教 (30432462)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
キーワードバイオインフォマティクス
研究実績の概要

脂肪細胞には白色と褐色の2種類があり,前者は脂肪滴の形でエネルギーを貯蔵するのに対し,後者は体温の維持のため脂肪を燃やして熱を発生させる.ある種の白色脂肪細胞は、寒冷条件下では褐色脂肪細胞のように熱を発生するベージュ脂肪細胞に転換することが知られている.
本研究では,寒冷曝露下でのマウスの各脂肪組織において計測した時系列のRNA-seqとマイクロアレイ,miRNAアレイによる発現プロファイルを用いて,遺伝子発現解析を行った.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

RNA-seqとマイクロアレイ,miRNAアレイによる発現プロファイルを用いて解析を行ってきたが,さらなる時系列データの取得を行う必要が生じた.研究協力者によりデータを取得したが成果をまとめた学会での発表や論文化のスケジュールに遅れが生じた.

今後の研究の推進方策

平成27年度には成果のとりまとめと成果発表を行うこととする.

次年度使用額が生じた理由

RNA-seqとマイクロアレイ,miRNAアレイによる発現プロファイルを用いて解析を行ってきたが,さらなる時系列データの取得を行う必要が生じた.研究協力者によりデータを取得したが,成果をまとめた学会での発表や論文化のスケジュールに遅れが生じた.

次年度使用額の使用計画

成果のとりまとめと成果発表を次年度に行うこととし,最終年度に計上していた旅費,論文の校正費用,論文の印刷費用をその経費に充てることとしたい.

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Metagenome fragment classification based on multiple motif-occurrence profiles2014

    • 著者名/発表者名
      Naoki Matsushita, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
    • 雑誌名

      PeerJ

      巻: 2 ページ: e559

    • DOI

      https://dx.doi.org/10.7717/peerj.559

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法2014

    • 著者名/発表者名
      津田絢子,瀬尾茂人,竹中要一,松田秀雄
    • 学会等名
      第98回MPS・第38回BIO合同研究発表会
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27

URL: 

公開日: 2016-06-01  

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