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2015 年度 実績報告書

ワークスティーリングを用いた分散並列環境における遺伝子制御ネットワーク推定手法

研究課題

研究課題/領域番号 24700295
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

木戸 善之  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 客員研究員 (70506310)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
キーワード分散コンピューティング / 遺伝子発現ネットワーク推定 / ジョブスケジューラ / 可視化
研究実績の概要

本研究は,遺伝子発現プロファイルによる大規模な遺伝子制御ネットワーク推定のための分散並列手法ならびにその周辺技術の研究開発を行ってきた.平成27年度では前年度までに開発したスケジューラフレームワークならびにプロトタイプスケジューラの改良および,大規模な遺伝子制御ネットワーク推定の結果を出力するため,可視化アプリケーションの開発を行い,国際会議にて報告を行い,本研究の一部の成果について論文にまとめた.またネットワーク解析には遺伝子のアノテーション情報も必要とされ,課題から派生した遺伝子制御ネットワーク解析に関連するメタデータ/オントロジー構築についても一部成果として報告を行った.
[1] A High Resolution Graph Viewer for Multi-monitor Visualization Environment, Ryoichi Jingai, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Shinji Shimojo, The Review of Socionetwork Strategies,Volume 9, Issue 1, pp.19-27, Jun. 2015
[2] An Ontology-Based Model Search Extended to Deal with Accessibility Issues of Neuroinformatics Metadata with Multidirectional Attributes , Yoshiyuki ASAI, Yoshiyuki KIDO, Kyota KAMIYOSHI, Taishin NOMURA, Hiroaki WAGATSUMA , INCF Japan Node International Workshop: Advances in Neuroinformatics 2015, Nov. 2015.
[3] Improvement of Scalability in Sharing Visualization Contents for Heterogeneous Display Environments, Arata Endo, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Yasuhiro Watashiba, Kiyoshi Kiyokawa, Haruo Takemura, Shinji Shimojo,International Symposium on Grids & Clouds 2016 (ISGC2016), May 2016.

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A High Resolution Graph Viewer for Multi-monitor Visualization Environment2015

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Jingai, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Shinji Shimojo
    • 雑誌名

      The Review of Socionetwork Strategies

      巻: Volum 9, Issue 1 ページ: pp.19-27

    • DOI

      10.1007/s12626-015-0052-5

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Improvement of Scalability in Sharing Visualization Contents for Heterogeneous Display Environments2016

    • 著者名/発表者名
      Arata Endo, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Yasuhiro Watashiba, Kiyoshi Kiyokawa, Haruo Takemura, Shinji Shimojo
    • 学会等名
      International Symposium on Grids & Clouds 2016 (ISGC2016)
    • 発表場所
      Academia Sinica, 台北市, 台湾
    • 年月日
      2016-03-13 – 2016-03-18
    • 国際学会
  • [学会発表] An Ontology-Based Model Search Extended to Deal with Accessibility Issues of Neuroinformatics Metadata with Multidirectional Attributes2015

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki ASAI, Yoshiyuki KIDO, Kyota KAMIYOSHI, Taishin NOMURA, Hiroaki WAGATSUMA
    • 学会等名
      INCF Japan Node International Workshop: Advances in Neuroinformatics 2015
    • 発表場所
      東京大学先端科学技術研究センター, 目黒区, 東京都
    • 年月日
      2015-11-26 – 2015-11-27
    • 国際学会
  • [備考]

    • URL

      http://handai.tk/~kido/

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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