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2012 年度 実施状況報告書

血清検体を用いたEML4-ALK検出

研究課題

研究課題/領域番号 24701013
研究機関近畿大学

研究代表者

坂井 和子  近畿大学, 医学部, 助教 (20580559)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
キーワードバイオマーカー
研究概要

(1) EML4-ALK融合遺伝子測定系のマルチプレックス化の検討: EML4-ALK融合遺伝子のマルチプレックス化を試みた。EML4-ALK融合遺伝子の9種のバリアントのマルチプレックス測定用プライマーをデザインし測定系の検証を行ったが、プライマー相互作用によりマルチプレックス化が困難であった。そのため、EML4-ALK融合遺伝子の主たるバリアントであるバリアント1、2、3に絞ったマルチプレックス測定系を構築した。
(2) 血清検体でのEML4-ALK測定条件の最適化: まず、血清からのRNA抽出条件として、TRIzol法とカラム法を検討した結果、収量と操作安定性の観点からカラム法を選択した。血清由来RNAの逆転写反応には、組織検体で用いたRandom Hexamerではなく、ALK特異的プライマーを使用した。最終的に、血清由来RNAを鋳型としたEML4-ALK融合遺伝子の検出には、逆転写反応用プライマーとしてALK特異的プライマーを用い、One-Step RT-PCRによる目的部位の増幅を行うことで検出が可能となった。
(3) 血清を用いた測定実施のための準備: EML4-ALK陽性患者の血清の収集のため、試料提供機関である癌研有明病院呼吸器センターおよび測定機関である近畿大学医学部に申請、承認された研究計画に基づき、蛍光in situハイブリダイゼーションによる12名のEML4-ALK陽性患者および12名のEML4-ALK陰性患者の血清の収集を行った。
(4) 血清検体の測定: (2)で検討した手法を用いて、血清検体での測定を実施した結果、EML4-ALK陽性患者の血清からバリアント1(1/12)およびバリアント3a(1/12)を検出した。検出されたEML4-ALK融合遺伝子は、サブクローニングとダイレクトシークエンスにより確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度、血清由来RNAを鋳型としたEML4-ALK融合遺伝子の検出系を確立し、実際に臨床検体を用いた測定を実施した。その結果、蛍光in situハイブリダイゼーションにより決定されたEML4-ALK陽性患者の患者血清からEML4-ALK融合遺伝子を検出した。本年度の研究計画に対する目標は達成しており、概ね順調に進展していると考えられる。

今後の研究の推進方策

EML4-ALK陽性患者の患者血清から検出されたEML4-ALK融合遺伝子の割合は、12例中2例と低いものであった。血清中に遊離している腫瘍由来RNAが微量かつ不安定であることが一因と考えられるため、血清からのRNA抽出法として磁性ビーズを用いた抽出RNAの収量の改善を図る。また、患者血清とペアの組織検体を用いて組織検体でのEML4-ALK融合遺伝子検出の一致率を検討する。

次年度の研究費の使用計画

RNA抽出法の改善を図るため、磁性ビーズによる抽出法の検討を実施する。また、組織検体でのEML4-ALK融合遺伝子の検討を行い、血清中での検出検体との比較を行う。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] A novel mass spectrometry-based assay for diagnosis of EML4-ALK-positive non-small cell lung cancer2012

    • 著者名/発表者名
      Sakai K. et al
    • 雑誌名

      J Thorac Oncol

      巻: 7 ページ: 913-8

    • DOI

      10.1097/JTO.0b013e31824c7f7a

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical outcome for EML4-ALK-positive patients with advanced non-small-cell lung cancer treated with first-line platinum-based chemotherapy2012

    • 著者名/発表者名
      Takeda M. et al
    • 雑誌名

      Ann Oncol

      巻: 23 ページ: 2931-6

    • DOI

      10.1093/annonc/mds124

    • 査読あり
  • [学会発表] Detection of EML4-ALK in serum RNA from lung cancer patients using MassARRAY platform2012

    • 著者名/発表者名
      Kudo K. et al
    • 学会等名
      2012 ASCO Annual Meeting
    • 発表場所
      Chicago, USA
    • 年月日
      20120602-20120602

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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