血管内皮細胞分化におけるエピジェネティクス解析

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24710227
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: システムゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 神吉 康晴 東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: エピゲノム制御 / 血管内皮細胞 / 細胞分化 / 転写因子

研究概要

本研究では、血管内皮細胞に焦点をあて、その分化機構を転写因子とエピゲノム修飾因子の視点から解析し、新たな分化制御因子を発見するのが目的である。マウスES細胞からの血管内皮細胞分化系を用いて、経時的なtranscriptome解析及びヒストン修飾解析を行った。その結果、特徴的なヒストン修飾パターンから、Gata2、Fli1、Sox7、Sox18を見出した。これら4つの転写因子をそれぞれノックダウンするとGata2のみでも内皮細胞分化は約50%阻害され、4つの転写因子を全てノックダウンすると顕著に阻害される結果となった。本研究により、血管内皮細胞分化の新たな転写因子ネットワークを提唱した。

研究成果

• [雑誌論文] Revolution of nephrology research by deep sequencing : ChIP-seq and RNA-seq (2014)
  • 著者名/発表者名: Mimura I, Kanki Y, Kodama T, Nangaku M
  • 雑誌名: Kidney Int 巻: 85(1) ページ: 31-38
  • DOI: 10.1038/ki.2013.321
  • 査読あり
• [雑誌論文] GATA factor switching from GATA2 to GATA1 contributes to erythroid differentiation (2013)
  • 著者名/発表者名: Suzuki M, Kobayashi-Osaki M, Tsutsumi S, Pan X, Ohmori S, Takai J, Moriguchi T, Ohneda O, Ohneda K, Shimizu R, Kanki Y, Kodama T, Aburatani H, Yamamoto M
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 18(11) ページ: 921-933
  • DOI: 10.1111/gtc.12086
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor-associated macrophages (2013)
  • 著者名/発表者名: Osawa T, Tsuchida R, Muramatsu M, Shimamura T, Wang F, Suehiro J, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 73(10) ページ: 3019-3028
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-12-3231
  • 査読あり
• [雑誌論文] TNFαsignals through specialized factories where responsive coding and miRNA genes are transcribed (2012)
  • 著者名/発表者名: Papantonis A, Kohro T, Baboo S, Larkin JD, Deng B, Short P, Tsutsumi S, Taylor S, Kanki Y, Kobayashi M, Li G, Poh HM, Ruan X, Aburatani H, Ruan Y, Kodama T, Wada Y
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 31(23) ページ: 4404-4414
  • DOI: 10.1038/emboj.2012.288
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic change of chromatin conformation in response to hypoxia enhances the expression of GLUT3 (SLC2A3) by cooperative interaction of hypoxia-inducible factor 1 and KDM3A (2012)
  • 著者名/発表者名: Mimura I, Nangaku M, Kanki Y, Tsutsumi S, Inoue T, Kohro T, Yamamoto S, Fujita T, Shimamura T, Suehiro J, Taguchi A, Kobayashi M, Tanimura K, Inagaki T, Tanaka T, Hamakubo T, Sakai J, Aburatani H, Kodama T, Wada Y
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 巻: 32(15) ページ: 3018-3032
  • DOI: 10.1128/MCB.06643-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alternative splicing of CD44 mRNA by ESRP1 enhances lung colonization of metastatic cancer cell (2012)
  • 著者名/発表者名: Yae T, Tsuchihashi K, Ishimoto T, Motohara T, Yoshikawa M, Yoshida GJ, Wada T, Masuko T, Mogushi K, Tanaka H, Osawa T, Kanki Y, Minami T, Aburatani H, Ohmura M, Kubo A, Suematsu M, Takahashi K, Saya H, Nagano O
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 3 ページ: 883
  • DOI: 10.1038/ncomms1892
  • 査読あり
• [学会発表] A novel epigenetic mechanism revealed tumor associated angiogenesis (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
  • 年月日: 20131003-05
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
  • 年月日: 20130911-13
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: The 11th Japan-Korea Joint Symposium on Vascular Biology
  • 発表場所: Hyatt Regency Jeju Hotel, Korea
  • 年月日: 20130821-24
• [学会発表] Comprehensive analyses revealed the epigenetic switch during the endothelial cell differentiation (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第12回日本再生医療学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
  • 年月日: 20130321-23
• [学会発表] Two transcription factors mediated opposite chromatin conformation correlates with endothelial cell specificity (2012)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、福岡県
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Molecular mechanism about sustained VCAM-1 induction by the transcriptome and epigenomic analyses (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: 第20回日本血管生物医学会学術集会(The 10th Korea-Japan Joint Symposium on Vascular Biology)
  • 発表場所: 徳島あわぎんホール、徳島県
  • 年月日: 20121205-07
• [学会発表] The initiation step about the changes of transcription factor bindings and histone modifications is involved in sustained gene inductions (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: Keystone Symposia 2013 Aging and Diseases of Aging
  • 発表場所: Miyako Hotel Tokyo、東京都
  • 年月日: 20121022-27
• [学会発表] Regulation of the Endothelial-Mesenchymal Transition (EndMT) (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館、北海道
  • 年月日: 20120919-21
• [学会発表] Epigenetic Switch on the Differentiation of Mouse Vascular Endothelial Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: International Society for Stem Cell Research 10th Annual Meeting
  • 発表場所: Pacifico Yokohama、神奈川県
  • 年月日: 20120613-16
• [図書] 血管医学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 総ページ数: 9
  • 出版者: メディカルレビュー社
• [産業財産権] 血管内皮細胞の活性化に起因する疾患の治療又は予防剤 (2014)
  • 発明者名: 南 敬, 神吉 康晴, 末弘 淳一
  • 権利者名: 東京大学TLO/JST
  • 産業財産権種類: PCT
  • 産業財産権番号: JP2014/051830
  • 取得年月日: 2014-01-28
  • 外国