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2014 年度 実績報告書

リン酸化モチーフの比較進化解析から細胞機能とモチーフの関係を明らかにする

研究課題

研究課題/領域番号 24770190
研究機関金沢医科大学

研究代表者

吉崎 尚良  金沢医科大学, 医学部, 助教 (00443490)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワードリン酸化シグナル / リン酸化モチーフ / 比較ゲノム解析
研究実績の概要

タンパク質リン酸化はキナーゼによって担われる修飾で、あらゆる生命現象の調節に働く。キナーゼは、516種類がヒトゲノム上にコードされ、ヒトゲノム上の2%以上を占める大きなファミリーを形成している。リン酸化シグナルネットワークの整理は生命現象の解明に重要な役割を持つ。膨大なリン酸化サイト情報を整理するため、まずリン酸化サイトのデータベース(Phosphosite Plus)のデータセットを用い周辺配列をMCLクラスタリングすることで、178のリン酸化モチーフを決定した。次にリン酸化モチーフの生理的重要性を調べるため、リン酸化モチーフは、KEGGのorthologueグループを利用し、リン酸化サイトの比較進化解析を、ヒト、チンパンジー、マウス、イヌ、ゼブラフィシュ、ショウジョウバエ、線虫、分裂酵母、出芽酵母の9種類の種に対して行った。その結果、特定の種から保存性が急増する16モチーフを発見した。線虫から保存性が増加するモチーフは、キナーゼドメインおよび、キナーゼ調節領域に集中していた。またショウジョウバエから増加するモチーフは転写調節をになるZincfingerドメインおよび、近傍の配列であった。ゼブラフィッシュから増加するモチーフは、スプライシング、細胞骨格およびインスリンシグナル経路の関連因子に有意に存在することが分かった。またそれらのモチーフのネットワーク解析を行ったところ、酵母まで保存されている生命のコアシグナルに対し直接相互作用する分子に有意に存在することが分かった。この結果は特定種から増加するモチーフを解析することで、進化的に付加された調節回路を同定できることを示唆した。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Large-scale analysis of evolutionary histories of phosphorylation motifs in the human genome.2015

    • 著者名/発表者名
      Hisayoshi Yoshizaki and Shujiro Okuda
    • 雑誌名

      GigaScience

      巻: 4 ページ: 21

    • DOI

      10.1186/s13742-015-0057-6

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Elucidation of the evolutionary expansion of phosphorylation signaling networks using comparative phosphomotif analysis.2014

    • 著者名/発表者名
      Hisayoshi Yoshizaki and Shujiro Okuda
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 15 ページ: 546

    • DOI

      10.1186/1471-2164-15-546

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Large-scale analysis of the evolutionary history of phosphorylation motifs2014

    • 著者名/発表者名
      Shujiro Okuda and Hisayoshi Yoshizaki
    • 学会等名
      The 2014 ASCB / IFCB Meeting
    • 発表場所
      Philadelphia, Pennsylvania, USA
    • 年月日
      2014-12-06 – 2014-12-10
  • [学会発表] Comparative phospho-motif analysis reveals the evolutionary expansion of phosphorylation signaling networks.2014

    • 著者名/発表者名
      吉崎尚良、奥田修二郎
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [学会発表] PKNシグナル伝達のリン酸化プロテオーム解析2014

    • 著者名/発表者名
      野田 陽平、吉崎 尚良、向井 秀幸、早野 俊哉
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [学会発表] 細胞分裂期におけるPKNの基質の網羅的同定2014

    • 著者名/発表者名
      竹林 輝、野田 陽平、吉崎 尚良、向井 秀幸、早野 俊哉
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [学会発表] Characterization of protein phosphorylation in the context of evolution.2014

    • 著者名/発表者名
      Shujiro Okuda and Hisayoshi Yoshizaki
    • 学会等名
      22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
    • 発表場所
      Boston USA
    • 年月日
      2014-07-11 – 2014-07-15

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公開日: 2016-06-01  

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