ブラシカのエピゲノム解析及び、植物形質に関わる後天的な転写制御の解明に向けて

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24780002
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 神戸大学 (2013); 新潟大学 (2012)
• 研究代表者: 藤本 龍 神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (60620375)
• 研究協力者: 川辺 隆大 (株)渡辺採種場, 研究員 ; 加治 誠 (株)渡辺採種場, 研究部, 部長 (60545010) ; 岡崎 桂一 新潟大学, 大学院自然科学研究科, 教授 (20270936)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: エピゲノム / アブラナ科

研究概要

本研究では、日本及びアジア地域で主要な野菜であるハクサイ (Brassica rapa)を用いて、ゲノム全体のエピジェネティックな修飾状態を明らかにすることを目的として研究を行った。ゲノム全体のDNAのメチル化状態とヒストンの化学修飾状態について調べた。また、春化処理後や、病原菌感染時にみられるゲノムワイドなエピジェネティックな修飾状態を明らかにすることを目的に研究を行った。春化処理後には、鍵遺伝子であるFLCにH3K27me3の修飾が蓄積し、FLCの転写レベルが下がることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of candidate genes for fusarium yellows resistance in Chinese cabbage by differential expression analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Shimizu M, Fujimoto R, Ying H, Pu ZJ, Ebe Y, Kawanabe T, Saeki N, Taylor JM, Kaji M, Dennis ES, Okazaki K.
  • 雑誌名: Plant Mol Biol 巻: 85 ページ: 247-257
  • DOI: 10.1007/s11103-014-0182-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptional regulation of key gene of vernalization, FLOWERING LOCUS C (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Osabe K, Okazaki K, Fujimoto R.
  • 雑誌名: Bull Facul Agric Niigata Univ 巻: 66 ページ: 105-110
• [雑誌論文] Accumulation of quantitative trait loci conferring broad-spectrum clubroot resistance in Brassica oleracea (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomita H, Shimizu M, Doullah MDA, Fujimoto R, Okazaki K.
  • 雑誌名: Mol Breed 巻: 32 ページ: 889-900
  • DOI: 10.1007/s11032-013-9918-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular mechanisms of epigenetic variation in plants (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto R, Sasaki T, Ishikawa R, Osabe K, Kawanabe T, Dennis ES.
  • 雑誌名: Int J Mol Sci 巻: 13 ページ: 9900-9922
  • DOI: 10.3390/ijms13089900
  • 査読あり
• [学会発表] Differential expression解析を用いたハクサイ萎黄病抵抗性候補遺伝子の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 清水元樹、江部裕介、川辺隆大、佐伯なつみ、加治誠、岡崎桂一、藤本龍
  • 学会等名: 園芸学会平成26年度春季大会
  • 発表場所: 筑波大学
  • 年月日: 20140329-30
• [学会発表] Brassica oleracea品種における萎黄病抵抗性遺伝子FocBo1連鎖DNAマーカーと抵抗性との関連性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 清水元樹、川辺隆大、Pu Zi-jing、藤本龍、岡崎桂一
  • 学会等名: 日本育種学会第125回講演会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 年月日: 2013-10-13
• [学会発表] Brassica oleracea染色体添加型B. rapaを用いた緑植物体春化の遺伝解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 戸丸祐貴、中村友理、清水元樹、藤本龍、岡崎桂一
  • 学会等名: 日本育種学会第124回講演会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 年月日: 2013-10-13
• [学会発表] アブラナ科植物の種内、種間雑種に見られる非相加的遺伝子発現 (2013)
  • 著者名/発表者名: 藤本龍
  • 学会等名: 日本育種学会第123回講演会グループ研究集会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2013-03-28
• [学会発表] Towards identifying a fusarium wilt resistance gene in Chinese cabbage (Brassica rapa ssp. pekinensis) (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomita H, Shimizu M, Ebe Y, Ying H, Kawanabe T, Kaji M, Fujimoto R, Dennis ES, Okazaki K.
  • 学会等名: 10th International Congress on Plant Molecular Biology
  • 発表場所: Jeju, Korea
  • 年月日: 20121021-26
• [学会発表] Characterization of NBS-LRR motif genes between S11 and R09 by RNA sequencing in Brassica rapa (2012)
  • 著者名/発表者名: Shimizu M, Ying H, Fujimoto R, Ebe Y, Tomita H, Kawanabe T, Kaji M, Dennis ES, Okazaki K.
  • 学会等名: 10th International Congress on Plant Molecular Biology
  • 発表場所: Jeju, Korea
  • 年月日: 20121021-26
• [学会発表] RNA-sequence法を用いたハクサイ品種間(S11×R09)特異的なNBS-LRRモチーフ遺伝子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 清水元樹、江部裕介、藤本龍、川邊隆大、Hua Ying、加治誠、Elizabeth Dennis、岡崎桂一
  • 学会等名: 日本育種学会第122回講演会
  • 発表場所: 京都産業大学
  • 年月日: 2012-09-15
• [図書] The role of DNA methylation in plants (2013)
  • 著者名/発表者名: Osabe K, Sasaki T, Ishikawa R, Fujimoto R.
  • 総ページ数: 35-66
  • 出版者: Nova Science Publisher