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2014 年度 実施状況報告書

双生児のゲノム・エピゲノム比較解析に基づく先天異常の環境要因遺伝子に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 24792305
研究機関昭和大学

研究代表者

萬屋 礼子  昭和大学, 歯学部, 助教 (30384340)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
キーワード双生児 / ゲノム / エピゲノム / 先天異常 / 環境要因
研究実績の概要

矯正歯科治療を要する先天異常のうち、唇顎口蓋裂の一卵性双生児(裂児・非裂児ペア)を対象にゲノム・エピゲノムの網羅的解析を行い、双子間でのCNVやDNAメチル化発現の差異の有無・領域の特定、さらにはこの発現差異を認める遺伝子、すなわち双子間の障害差異要因を探求することで、唇顎口蓋裂の発生原因探索を行っている。
昨年度、卵性診断を行い一卵性双生児であることを確認し、電気泳動による方法およびQ-DNA定量による方法により、検体の品質評価を行った。その後、全ゲノムSNPジェノタイピングを行い、SNPおよびCNVコピー数の異常(欠失、Copy-neutral LOH、増幅)を口蓋裂の原因遺伝子といわれている既知のものについて検出・解析を行った。同結果を一卵性双生児間比較を行った結果、唇顎口蓋裂児に、非罹患児にない特徴が若干みられた。
本年度は同結果を詳細に解析した結果、有意差を示すことはできないとの結果を得た。そのため、今後は解析対象を基地既知のものだけでなく網羅的い行うことで、新たな遺伝子へのアプローチを行う予定である。さらに、両児ともに唇顎口蓋裂である一卵性双生児を対象に加え、一卵性で同じ口蓋裂という発現形を持っている中で同解析を行い、罹患同士の中でもCNVコピー数の差等、傾向の有無の存在について検討したいと考えている。まずは新たに参加していただく患児とその保護者への説明を行い、同意を得たうえで、卵性診断を行う準備を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

平成25年度に行った下記解析結果を、本年度はさらに詳細に解析しあ結果、有意差はみられないとなった。
1.卵性診断
2.双子間差異を呈するCNV領域の同定実験
3.関連遺伝子近傍のCNV選定
そのため、裂児・非裂児のペアのほかに、裂児・裂児のペアである一卵性双生児を解析対象に加え、双生児間比較を多角的に行う必要性がでたため、期間を延期する必要があることから、やや遅れていると判断した。

今後の研究の推進方策

今後、一卵性確認後、CNV差異の有無の確認、そして、裂児・非裂児ペア、裂児・裂児ペア間比較も行い、唇顎口蓋裂発生原因を探求する予定である。

次年度使用額が生じた理由

平成25年度に行った卵性診断・双子間差異を呈するCNV領域の同定実験
・関連遺伝子近傍のCNV選定解析結果を、本年度はさらに詳細に解析しあ結果、有意差はみられないとなった。そのため、裂児・非裂児のペアのほかに、裂児・裂児のペアである一卵性双生児を解析対象に加え、双生児間比較を多角的に行う必要性がでたため。

次年度使用額の使用計画

対象に加えた裂児・裂児ペアの卵性確認後、CNV差異の有無の確認、そして、裂児・非裂児ペア、裂児・裂児ペア間比較も行い、唇顎口蓋裂発生原因を探求する予定である。

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公開日: 2016-06-01  

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