2013 年度研究成果報告書

レクチン・複合糖鎖結合予測のための統計的方法論の開発

研究課題

研究課題/領域番号	24810010
研究種目	研究活動スタート支援
配分区分	補助金
研究分野	ゲノム生物学
研究機関	金沢大学
研究代表者	広瀬修金沢大学, 電子情報学系, 助教 (30549671)
研究期間 (年度)	2012-08-31 – 2014-03-31
キーワード	レクチン / 複合糖鎖 / 判別分析 / 機械学習
研究概要	糖鎖は単糖類が重合した物質で，特に複合糖鎖と呼ばれる糖鎖は細胞表面などに存在する糖タンパク質に結合し，発生・分化・免疫・癌化・感染といった生体内のあらゆる局面で重要な役割を果たす．糖鎖に対する構造解析法の近年の急激な進展によって，糖鎖や糖鎖認識タンパク質であるレクチンに関する情報が急速に蓄積しつつあり，糖鎖生物学の飛躍的な進展が期待されている．本研究課題期間に特にレクチンに関して以下の様な進捗があった．(1)タンパク質データベースからのレクチンの配列情報の取得およびキュレーション．(2)局所フィッシャー判別分析による配列情報からのレクチン予測．(3)レクチンを特徴付けるアミノ酸配列の推定．