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2013 年度 実績報告書

II型生合成酵素の触媒ドメイン間相互作用解析を指向したケミカルツールの創製と応用

研究課題

研究課題/領域番号 24810015
研究機関京都大学

研究代表者

石川 文洋  京都大学, 生理化学研究ユニット, 助教 (50631553)

研究期間 (年度) 2012-08-31 – 2014-03-31
キーワード生合成 / ポリケタイド合成酵素 / 脂肪酸合成酵素 / パンテテインアナログ / タンパク質-タンパク質相互作用
研究概要

微生物が産生する代謝産物は, その生物活性の多様性から生物学において重要な研究ツールとなり創薬シーズとなってきたことは疑う余地のない事実である. そのような天然物の多くは脂肪酸合成酵素 (FAS), ポリケタイド合成酵素 (PKS) および非リボソーム性ペプチド合成酵素 (NRPS) と呼ばれる酵素群によって合成される. そのため, これら酵素システムを人為的に改変し非天然化合物を創出する試みが多数報告されているが, タンパク質工学的手法が成熟しつつある今日においても容易ではない. 一因として, これら酵素システムの触媒ドメイン間の相互作用に関する構造情報が非常に限られているという事実がある. 本研究では触媒ドメイン間の相互作用を解析するためのケミカルツールを開発し, この相互作用を分子レベルで解明することを目的とした. 基質アナログであるクロスリンク剤をツールにII型FAS CP-DH触媒ドメイン間相互作用の解析を行った. CPと個々の触媒ドメイン間の相互作用は非常に弱いため共結晶構造を解くことができない. しかしながらクロスリンク剤と組み合わせることでCP-DHクロスリンク種のX線結晶構造解析を行うことが可能となり, 反応が起る瞬間のCP-DH相互作用の全貌が明らかとなった. これら構造情報をもとに, 最適なスワッピングペアの探索あるいは非天然相互作用の最適化をクロスリンク反応を道標に行うことが可能となり, 生合成経路の設計に一石を投じることができるかもしれない. 同時に, 一次代謝酵素である脂肪酸合成酵素のタンパク質-タンパク質相互作用を阻害する化合物の探索も可能となり, 新しい作用点をもつ抗生物質の開発につながると期待している.

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] A 7-dimethylallyl tryptophan synthase from a fungal Neosartorya sp.: biochemical characterization and structural insight into the regioselective prenylation2014

    • 著者名/発表者名
      Kengo Miyamoto, Fumihiro Ishikawa, Shinya Nakamura, Yutaka Hayashi, Isao Nakanishi, Hideaki Kakeya
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 22 ページ: 2517-2528

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.02.031

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specific enrichment of nonribosomal peptide synthetase module by an affinity probe for adenylation domains2014

    • 著者名/発表者名
      Fumihiro Ishikawa, Hideaki Kakeya
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 24 ページ: 865-869

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.12.082

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Trapping the dynamic acyl carrier protein in fatty acid biosynthesis2014

    • 著者名/発表者名
      Chi Nguyen, Robert W. Haushalter, D.John Lee, Phineus R.L.Markwick, Joel Bruegger, Grace Caldara-Festin, Kara Finzel, David R.Jackson, Fumihiro Ishikawa, Bing O'Dowd, J.Andrew McCammon, Stanley J.Opella, Shiou-Chuan Tsai, Michael D.Burkart
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 505 ページ: 427-431

    • DOI

      10.1038/nature12810

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sulfonyl 3-alkynyl pantetheinamides as mechanism-based crosslinkers of ACP dehydratase2013

    • 著者名/発表者名
      Fumihiro Ishikawa, Robert W.Haushalter, D.John Lee, Kara Finzel, and Michael D.Burkart
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 135 ページ: 8846-8849

    • DOI

      10.1021/ja4042059

    • 査読あり
  • [学会発表] 光親和性プローブを利用したアデニレーションドメインに対するリガンド依存的標識化2014

    • 著者名/発表者名
      今野翔, 石川文洋, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本薬学会134年会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      20140327-20140330
  • [学会発表] アデニレーションドメインに対する高親和性プローブ開発を基盤とした二次代謝産物合成酵素およびその遺伝子クラスターの同定法の確立2013

    • 著者名/発表者名
      石川文洋
    • 学会等名
      第5回食品薬学シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20131101-20131102
    • 招待講演
  • [学会発表] 糸状菌Neosartorya属由来プレニル基転移酵素に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      宮本健吾,石川文洋,林豊,掛谷秀昭
    • 学会等名
      第5回食品薬学シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      20131100
  • [学会発表] Andrimidの生合成酵素の機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      杉本泰康,石川文洋,宮本健吾,栗田雅史,今野翔,掛谷秀昭
    • 学会等名
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      20130900
  • [学会発表] アデニレーションドメインを標的とした光親和性プローブの開発2013

    • 著者名/発表者名
      今野翔,石川文洋,掛谷秀昭
    • 学会等名
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      愛知
    • 年月日
      20130900
  • [学会発表] 糸状菌Neosartorya sp. 由来プレニル基転移酵素の機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      宮本健吾, 石川文洋, 林 豊, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会・第8回年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20130619-20130621
  • [学会発表] Adenylationドメインを標的とした高親和性プローブの開発2013

    • 著者名/発表者名
      石川文洋, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会・第8回年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20130619-20130621
  • [学会発表] LC-MS/MSを用いた低分子プローブに対する標的タンパク質の同定2013

    • 著者名/発表者名
      石川文洋, 掛谷秀昭
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      鳥取
    • 年月日
      20130612-20130614
    • 招待講演

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公開日: 2015-05-28  

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