外生菌根菌の進化とその種多様化の起源を探る

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24870017
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 佐藤 博俊 京都大学, 人間・環境学研究科(研究院), 研究員 (10635494)
• 研究期間 (年度): 2012-08-31 – 2014-03-31
• キーワード: 菌根 / 菌類 / 共生 / 進化 / DNA / 多様性

研究概要

研究成果の概要（和文）：本研究では、植物の重要な共生者である外生菌根菌の分子系統推定の精度を向上させることを目的とした研究を行った。従来、外生菌根菌の分子系統推定は数個程度の遺伝子の配列から行われていたが、推定精度を上げるためには大量の遺伝子配列で分子系統推定を行う必要があった。本研究では、菌のシングルコピー遺伝子を増幅できるPCRプライマーを新たに96ペア開発し、次世代シーケンサーを用いることでこれらの遺伝子配列を効率的に解読する方法を確立することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Diversity and Spatial Structure of Belowground Plant-fungal Symbiosis in a Mixed Subtropical Forest of Ectomycorrhizal and Arbuscular Mycorrhizal Plants (2014)
  • 著者名/発表者名: Toju H, Sato H and Tanabe AS
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 ページ: e86566
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0086566
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detection of the horizontal spatial structure of soil fungal communities in a natural forest (2014)
  • 著者名/発表者名: Kadowaki K, Sato H, Yamamoto S, Tanabe AS, Hidaka A, et al
  • 雑誌名: Population Ecology 巻: 56 ページ: 301-310
  • DOI: 10.1007/s10144-013-0424-z
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spatial Segregation and Aggregation of Ectomycorrhizal and Root-Endophytic Fungi in the Seedlings of Two Quercus Species (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto S, Sato H, Tanabe AS, Hidaka A, Kadowaki K, et al
  • 雑誌名: PloS one 巻: 9 ページ: e96363
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0096363
  • 査読あり
• [雑誌論文] How are plant and fungal communities linked to each other in belowground ecosystems? A massively parallel pyrosequencing analysis of the association specificity of root-associated fungi and their host plants (2013)
  • 著者名/発表者名: Toju H, Sato H, Yamamoto S, Kadowaki K, Tanabe AS, et al
  • 雑誌名: Ecology and Evolution 巻: 3 ページ: 3112-3124
  • DOI: 10.1002/ece3.706
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sharing of Diverse Mycorrhizal and Root-Endophytic Fungi among Plant Species in an Oak-Dominated Cool-temperate Forest (2013)
  • 著者名/発表者名: Toju H, Yamamoto S, Sato H and Tanabe AS
  • 雑誌名: PloS one 巻: 8 ページ: e78248
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0078248
  • 査読あり
• [雑誌論文] Community composition of root-associated fungi in a Quercus-dominated temperate forest : co-dominance of mycorrhizal and root-endophytic fungi (2013)
  • 著者名/発表者名: Toju H, Yamamoto S, Sato H, Tanabe AS, Gilbert GS, et al
  • 雑誌名: Ecology and Evolution 巻: 3 ページ: 1281-1293
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0078248
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mycophagy among Japanese macaques in Yakushima : fungal species diversity and behavioral patterns (2013)
  • 著者名/発表者名: Sawada A, Sato H, Inoue E, Otani Y and Hanya G
  • 雑誌名: Primates ページ: 1-9
  • DOI: 10.1007/s10329-013-0396-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Thirty-Year Survey Reveals That Ecosystem Function of Fungi Predicts Phenology of Mushroom Fruiting (2012)
  • 著者名/発表者名: Sato H, Morimoto S and Hattori T
  • 雑誌名: PloS one 巻: 7 ページ: e49777
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0049777
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modelling the global distribution of fungal species : new insights into microbial cosmopolitanism (2012)
  • 著者名/発表者名: Sato H, Tsujino R, Kurita K, Yokoyama K and Agata K
  • 雑誌名: Molecular Ecology 巻: 21 ページ: 5599-5612
  • DOI: 10.1111/mec.12053
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-Coverage ITS Primers for the DNA-Based Identification of Ascomycetes and Basidiomycetes in Environmental Samples (2012)
  • 著者名/発表者名: Toju H, Tanabe AS, Yamamoto S and Sato H
  • 雑誌名: PloS one 巻: 7 ページ: e40863
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0040863
  • 査読あり
• [学会発表] 真菌類ハラタケ亜門のシングルコピー遺伝子を対象としたユニバーサルプライマーの開発～次世代シーケンサーを用いた分子系統推定を目指して～ (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐藤博俊・田辺晶史・東樹宏和
  • 学会等名: 日本植物分類学会第13回大会
  • 発表場所: 熊本(口頭)
  • 年月日: 20140300
• [学会発表] マレーシアサラワク州の低地フタバガキ林における外生菌根菌と根圏内生菌の宿主特異性とα、β多様性について (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤博俊・服部力・東樹宏和
  • 学会等名: 第124回日本森林学会テーマ別セッション
  • 発表場所: 岩手
  • 年月日: 20130300
• [学会発表] 東南アジア熱帯雨林における根圏共生菌の多様性パターンと宿主特異性の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤博俊・服部力・東樹宏和
  • 学会等名: 日本植物分類学会第12回大会
  • 発表場所: 千葉(ポスター)
  • 年月日: 20130300
• [学会発表] シンポジウム:菌類におけるメタゲノム解析の現状と今後の展望-メタゲノム解析から何が分かるのか?- (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤博俊
  • 学会等名: 日本菌学会第55回大会
  • 発表場所: 岐阜
  • 年月日: 20120500
• [備考] アウトリーチ活動サイエンスカフェ～これからの「きのこ」の話をしよう～in虹色カフェ. 2012年11月(京都)