次世代シーケンサーで迫るナガキクイムシの共生微生物生態

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 24880034
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 森林科学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 遠藤 力也 独立行政法人理化学研究所, バイオリソースセンター, 協力研究員 (90634494)
• 研究期間 (年度): 2012-08-31 – 2014-03-31
• キーワード: ナラ枯れ / カシノナガキクイムシ / 養菌性キクイムシ / 次世代シーケンサー / 酵母生態 / メタゲノム / 太平洋型

研究概要

ナラ枯れの媒介者である“太平洋型”のナガキクイムシ（以下、“太平洋型”）について、坑道（巣）壁における微生物群集構造を明らかにした。
“太平洋型”を穿孔させたコナラ丸太を割材し、穿孔虫の蛹室2検体と水平坑道4検体の坑道片を切り出した。これらを希釈平板法（培養法）による菌類群集の解析、および次世代シーケンサーを用いた全微生物群集の解析（非培養法）に供試した。
希釈平板法によって、“太平洋型”の菌類群集はカシノナガキクイムシのものと酷似したものであることが判った。また非培養法によって、供試した6検体全てからActinomyces sp.が検出され、“太平洋型”の共生者である可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Cryptococcus terricola is a promising oleaginous yeast for biodiesel production from starch through consolidated bioprocessing (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanimura A, Takashima M, Sugita T, Endoh R, Kikukawa M, Yamaguchi S, Sakuradani E, Ogawa J, Ohkuma M, Shima J
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 4 ページ: 4776
  • DOI: 10.1093/gbe/evu067
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative genomics of Taphrina fungi causing varying degrees of tumorous deformity in plants (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsai IJ, Tanaka E, Masuya H, Tanaka R, Hirooka Y, Endoh R, Sahashi N, Kikuchi T
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 6(4) ページ: 861-872
  • DOI: 10.1038/srep04776
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selection of oleaginous yeasts with high lipid productivity for practical biodiesel production (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanimura A, Takashima M, Sugita T, Endoh R, Kikukawa M, Yamaguchi S, Sakuradani E, Ogawa J, Shima J
  • 雑誌名: Bioresource Technology 巻: 153 ページ: 230-235
  • DOI: 10.1016/j.biortech.2013.11.086
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taxonomic richness of yeasts in Japan within subtropical and cool temperature areas (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashima M, Sugita T, Van BH, Nakamura M, Endoh R, Ohkuma M
  • 雑誌名: PLos One 巻: 11 ページ: e50784
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0050784
  • 査読あり
• [雑誌論文] 森林甲虫と酵母 (2012)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也
  • 雑誌名: 日本森林学会誌 巻: Vol.94 ページ: 326-334
  • DOI: 10.4005/jjfs.94.326
  • 査読あり
• [学会発表] 和歌山県産ナガキクイムシPlatypus sp.の坑道の菌類群集 (2014)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也、升屋勇人、大熊盛也
  • 学会等名: 日本森林学会第125回大会
  • 発表場所: 大宮ソニックシティ(大宮)
  • 年月日: 2014-03-29
• [学会発表] Yeasts associated with Coleopteran beetles in Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Endoh R, Ohkuma M
  • 学会等名: The 13th International Conference of Culture Collections (ICCC 13)
  • 発表場所: 北京(中華人民共和国)
  • 年月日: 20130925-26
• [学会発表] 森に酵母資源の宝庫を見つける (2013)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也、升屋勇人、大熊盛也
  • 学会等名: 日本微生物資源学会第20回大会
  • 発表場所: つくば国際会議場(つくば)
  • 年月日: 2013-06-27
• [学会発表] 和歌山県産ナガキクイムシPlatypus sp.の坑道の菌類群集 (2013)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也、升屋勇人、大熊盛也
  • 学会等名: 日本菌学会第57回大会
  • 発表場所: 東京農業大学(東京)
  • 年月日: 2013-06-08
• [学会発表] 森の虫に有用酵母の故郷を見つける (2013)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也
  • 学会等名: 第5回新産業酵母研究会講演会
  • 発表場所: 東京大学(東京)
  • 年月日: 2013-05-24
• [学会発表] 酵母生態学に挑む、筑波大学プレ戦略イニシアティブ「生物機能の高度利用を目指した応用微生物学研究拠点」シンポジウムつくばの応用微生物研究～理研BRC-JCM (2012)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也
  • 学会等名: 産総研
  • 発表場所: 筑波大学(つくば)
  • 年月日: 2012-12-20
• [図書] 実践有用微生物培養のイロハ(片倉啓雄編)第5章継代と保存 (2014)
  • 著者名/発表者名: 遠藤力也、髙島昌子
  • 出版者: (株)エヌ・ティー・エス(印刷中)
• [備考] ①日本微生物資源学会第20回大会(〔学会発表〕③)において優秀発表賞受賞